28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3576 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  100 
 
 		 717 aa  1477    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 696 aa  248  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  24.66 
 
 		 692 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  23.68 
 
 		 725 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  25.06 
 
 		 726 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.93 
 
 		 707 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.21 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.21 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 809 aa  51.2  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 801 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.61 
 
 		 846 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  24.15 
 
 		 1434 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  27.75 
 
 		 807 aa  47.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  28.98 
 
 		 846 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 		 836 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.33 
 
 		 1429 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  23.76 
 
 		 1448 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  29.61 
 
 		 834 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.41 
 
 		 1426 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  27.8 
 
 		 807 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  29.83 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  22.84 
 
 		 1448 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 851 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.53 
 
 		 851 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  28.04 
 
 		 582 aa  45.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  24.74 
 
 		 888 aa  44.3  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.73 
 
 		 590 aa  44.3  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  21.92 
 
 		 820 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>