34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1861 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 692 aa  1407    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.45 
 
 		 696 aa  236  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  24.8 
 
 		 717 aa  178  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  25.26 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  26.65 
 
 		 725 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  24.6 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.53 
 
 		 701 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.21 
 
 		 701 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.62 
 
 		 744 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.97 
 
 		 725 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 740 aa  52.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1323  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.62 
 
 		 701 aa  51.6  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.122817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0331  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 1052 aa  51.6  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.57 
 
 		 2082 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2641  helicase-like protein  21.87 
 
 		 831 aa  49.3  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4391  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.77 
 
 		 842 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.84 
 
 		 873 aa  47.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 764 aa  48.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  28.72 
 
 		 2124 aa  47.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  26.09 
 
 		 1448 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  28.65 
 
 		 1578 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.46 
 
 		 1412 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  25.35 
 
 		 870 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  29.73 
 
 		 2125 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.2 
 
 		 759 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  28.57 
 
 		 1321 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  29.12 
 
 		 2224 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 744 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  25.56 
 
 		 922 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.33 
 
 		 1584 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  24.88 
 
 		 815 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.09 
 
 		 751 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  25.36 
 
 		 1448 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 744 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>