More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0511 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
1542 aa  702    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.68 
 
 
1561 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
1602 aa  897    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.37 
 
 
1525 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  100 
 
 
1578 aa  3279    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
1607 aa  863    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.13 
 
 
1543 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 
1543 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.06 
 
 
1589 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.68 
 
 
2093 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23 
 
 
1764 aa  307  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.09 
 
 
2099 aa  248  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.02 
 
 
1740 aa  241  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  25.39 
 
 
2097 aa  191  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 
1787 aa  184  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.56 
 
 
685 aa  177  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  25.04 
 
 
1784 aa  170  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1759 aa  168  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.59 
 
 
2104 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.59 
 
 
2104 aa  166  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  24.01 
 
 
1838 aa  166  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  26.07 
 
 
2104 aa  165  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
1743 aa  164  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.07 
 
 
2104 aa  164  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.84 
 
 
1770 aa  163  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  26.18 
 
 
2106 aa  163  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.01 
 
 
2082 aa  162  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 
2136 aa  159  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
1754 aa  159  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.05 
 
 
1734 aa  158  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.71 
 
 
1861 aa  158  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
1698 aa  157  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
1741 aa  156  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.11 
 
 
2120 aa  155  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  23.89 
 
 
2113 aa  155  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.62 
 
 
1711 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.19 
 
 
1672 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.76 
 
 
2113 aa  153  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.74 
 
 
2113 aa  152  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
2113 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  23.67 
 
 
1422 aa  149  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  33.33 
 
 
2224 aa  148  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.52 
 
 
1741 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  31.61 
 
 
2087 aa  147  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.84 
 
 
1725 aa  147  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
2213 aa  145  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.9 
 
 
1723 aa  141  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.26 
 
 
1711 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  30.77 
 
 
1704 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.44 
 
 
1722 aa  140  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  28.65 
 
 
2124 aa  136  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  31.18 
 
 
2125 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.84 
 
 
1723 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 
1695 aa  129  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
1719 aa  126  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  22.46 
 
 
1780 aa  123  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.2 
 
 
1765 aa  122  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  25.33 
 
 
1878 aa  117  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  26.76 
 
 
459 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  27.85 
 
 
321 aa  107  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 
739 aa  103  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  31.33 
 
 
948 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.71 
 
 
1948 aa  99.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
744 aa  98.6  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.61 
 
 
815 aa  93.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  28.81 
 
 
931 aa  93.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.02 
 
 
829 aa  91.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.65 
 
 
764 aa  89.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  26.89 
 
 
758 aa  89.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.19 
 
 
941 aa  88.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  31.94 
 
 
912 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  27.95 
 
 
905 aa  85.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.61 
 
 
815 aa  84.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
762 aa  84.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  29.17 
 
 
831 aa  84  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 
855 aa  83.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.65 
 
 
959 aa  82.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.91 
 
 
962 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.91 
 
 
758 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
1053 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  27.85 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.31 
 
 
1198 aa  79.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.88 
 
 
716 aa  79.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 
806 aa  79.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
807 aa  78.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.09 
 
 
790 aa  78.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.33 
 
 
685 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 
764 aa  78.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 
854 aa  77.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.15 
 
 
783 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 
740 aa  77.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
756 aa  77.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.05 
 
 
751 aa  77  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  26.5 
 
 
1210 aa  77  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  27.27 
 
 
986 aa  77  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.18 
 
 
744 aa  76.3  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 
759 aa  76.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.45 
 
 
973 aa  76.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  27.44 
 
 
833 aa  76.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 
805 aa  75.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>