More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1353 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 
2113 aa  1470    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.43 
 
 
2113 aa  1498    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.87 
 
 
2136 aa  1771    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  40.49 
 
 
2113 aa  1494    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  30.53 
 
 
2224 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  31.22 
 
 
2087 aa  815    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  29.44 
 
 
2124 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
2099 aa  4367    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
2213 aa  903    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  30.88 
 
 
2125 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.4 
 
 
2113 aa  1492    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  29.85 
 
 
2082 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.96 
 
 
1607 aa  315  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.32 
 
 
1602 aa  303  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.95 
 
 
1743 aa  265  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.29 
 
 
1861 aa  224  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.02 
 
 
1764 aa  190  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
1542 aa  185  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.01 
 
 
1543 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.01 
 
 
1543 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.24 
 
 
1561 aa  171  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  28.85 
 
 
2093 aa  167  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.29 
 
 
1525 aa  165  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1589 aa  165  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  22.8 
 
 
1578 aa  164  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 
1770 aa  154  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.33 
 
 
1711 aa  152  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.68 
 
 
1672 aa  150  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 
1734 aa  146  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 
1725 aa  144  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.4 
 
 
1698 aa  141  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  28.37 
 
 
1704 aa  141  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.3 
 
 
1741 aa  141  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
1695 aa  140  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  39.21 
 
 
1838 aa  140  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.89 
 
 
1754 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.33 
 
 
1722 aa  139  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  24.38 
 
 
1784 aa  138  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 
1723 aa  135  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.28 
 
 
1711 aa  132  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
685 aa  130  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.97 
 
 
1787 aa  130  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
2120 aa  128  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  33.33 
 
 
2106 aa  127  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 
1765 aa  123  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.21 
 
 
1723 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
1719 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  31.43 
 
 
2104 aa  119  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 
2104 aa  119  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 
2104 aa  119  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
1759 aa  117  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.44 
 
 
2104 aa  116  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  22.8 
 
 
1422 aa  109  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 
1741 aa  97.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  39.85 
 
 
2097 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  30.96 
 
 
1780 aa  87  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
815 aa  87  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.3 
 
 
739 aa  86.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.64 
 
 
1740 aa  86.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  33.88 
 
 
905 aa  84  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.44 
 
 
744 aa  79.3  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  31.53 
 
 
1878 aa  78.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.43 
 
 
1948 aa  78.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.53 
 
 
744 aa  77.4  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  25.96 
 
 
459 aa  77  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
1053 aa  76.3  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.11 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.33 
 
 
694 aa  74.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 
751 aa  73.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.68 
 
 
759 aa  73.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
738 aa  73.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 
808 aa  72.8  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.16 
 
 
1198 aa  72.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  29.54 
 
 
1475 aa  72  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  34.06 
 
 
321 aa  72  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 
744 aa  72  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.25 
 
 
972 aa  71.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
740 aa  71.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.77 
 
 
755 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  33.5 
 
 
710 aa  70.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  32.35 
 
 
736 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
763 aa  70.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
756 aa  70.5  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
1086 aa  70.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
926 aa  68.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.84 
 
 
941 aa  68.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.46 
 
 
807 aa  68.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.22 
 
 
736 aa  68.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  27.13 
 
 
1321 aa  67.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  30.21 
 
 
740 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  28.8 
 
 
862 aa  67.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 
685 aa  67.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  29.14 
 
 
815 aa  67  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.04 
 
 
955 aa  67.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.31 
 
 
959 aa  67.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.14 
 
 
758 aa  67  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.93 
 
 
962 aa  67  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  31.34 
 
 
986 aa  67  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  28.79 
 
 
758 aa  66.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
710 aa  66.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>