More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0833 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.42 
 
 
1722 aa  1021    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.5 
 
 
1672 aa  780    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 
1698 aa  802    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  41.34 
 
 
1704 aa  1161    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.05 
 
 
1723 aa  776    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.65 
 
 
1711 aa  1105    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 
1754 aa  1104    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.65 
 
 
1723 aa  977    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.48 
 
 
1743 aa  1333    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
1719 aa  776    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.71 
 
 
1725 aa  1240    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
1741 aa  1049    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.59 
 
 
1734 aa  1015    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1765 aa  3648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38 
 
 
1711 aa  985    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.64 
 
 
1770 aa  1553    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
1695 aa  1004    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.52 
 
 
1764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  27.91 
 
 
1838 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  44.65 
 
 
321 aa  184  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  28.73 
 
 
2087 aa  170  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.35 
 
 
1543 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.35 
 
 
1543 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.2 
 
 
1525 aa  158  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.66 
 
 
1542 aa  157  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.02 
 
 
1602 aa  150  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.91 
 
 
1561 aa  149  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 
1607 aa  146  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 
1861 aa  146  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.67 
 
 
2213 aa  142  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 
2136 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  26.16 
 
 
2125 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 
2099 aa  139  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  24.2 
 
 
1578 aa  132  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  35.97 
 
 
2082 aa  131  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
1589 aa  127  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  36.36 
 
 
2124 aa  127  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
2113 aa  126  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  36.89 
 
 
2224 aa  126  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  25.55 
 
 
2113 aa  125  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.31 
 
 
2113 aa  123  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
2113 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  36.67 
 
 
2106 aa  121  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.37 
 
 
2104 aa  115  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
2104 aa  115  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  30.86 
 
 
2104 aa  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  29.35 
 
 
1784 aa  110  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 
2120 aa  109  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.96 
 
 
2104 aa  108  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.37 
 
 
685 aa  107  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.37 
 
 
815 aa  97.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  40 
 
 
2097 aa  95.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.29 
 
 
2093 aa  94.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
959 aa  94  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
744 aa  94  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.97 
 
 
962 aa  94  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.72 
 
 
803 aa  91.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 
972 aa  90.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  34.15 
 
 
912 aa  90.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.05 
 
 
1759 aa  89.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.62 
 
 
1741 aa  89.4  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
861 aa  89  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.11 
 
 
807 aa  89  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.93 
 
 
973 aa  89  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.59 
 
 
790 aa  88.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 
1740 aa  88.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  22.18 
 
 
1422 aa  88.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
1787 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.93 
 
 
941 aa  86.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.15 
 
 
1198 aa  87  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.21 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.76 
 
 
789 aa  85.5  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.94 
 
 
1053 aa  85.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  30.22 
 
 
905 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.4 
 
 
744 aa  84.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  36.69 
 
 
986 aa  83.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  23.2 
 
 
1780 aa  83.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.55 
 
 
1086 aa  83.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.12 
 
 
1948 aa  81.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  28.89 
 
 
906 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.68 
 
 
758 aa  81.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  34.02 
 
 
804 aa  81.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.99 
 
 
808 aa  80.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.38 
 
 
739 aa  80.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.12 
 
 
752 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  36.2 
 
 
797 aa  80.1  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  31.66 
 
 
1178 aa  79.7  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.72 
 
 
751 aa  79.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 
764 aa  79.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  30.77 
 
 
758 aa  79  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 
838 aa  79  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
762 aa  79  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 
897 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  26.21 
 
 
1878 aa  78.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.16 
 
 
911 aa  78.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  31.22 
 
 
931 aa  76.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.14 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
744 aa  75.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
778 aa  75.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 
751 aa  74.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>