202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0240 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  100 
 
 
2097 aa  4295    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.67 
 
 
1787 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.39 
 
 
1759 aa  328  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  23.75 
 
 
2093 aa  251  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.38 
 
 
1741 aa  250  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.56 
 
 
1740 aa  247  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  27.59 
 
 
1784 aa  235  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.25 
 
 
1602 aa  212  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.1 
 
 
1607 aa  205  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  26.37 
 
 
1878 aa  205  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.18 
 
 
1578 aa  192  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.66 
 
 
1525 aa  187  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
1542 aa  171  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.46 
 
 
2104 aa  171  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.99 
 
 
1561 aa  169  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.1 
 
 
2120 aa  166  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.97 
 
 
1589 aa  164  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.35 
 
 
1948 aa  161  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  25.51 
 
 
2106 aa  152  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.27 
 
 
1543 aa  149  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
1543 aa  149  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  30.75 
 
 
1780 aa  147  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.23 
 
 
2113 aa  123  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.51 
 
 
2113 aa  122  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  24.51 
 
 
2113 aa  122  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.51 
 
 
2113 aa  122  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 
1422 aa  113  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.26 
 
 
2136 aa  114  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.47 
 
 
1770 aa  107  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.09 
 
 
2104 aa  105  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  46.09 
 
 
2104 aa  105  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.09 
 
 
2104 aa  105  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.68 
 
 
1754 aa  101  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.31 
 
 
1723 aa  100  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.31 
 
 
1719 aa  100  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.48 
 
 
1725 aa  99.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.69 
 
 
1734 aa  99.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.86 
 
 
1764 aa  97.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
1722 aa  97.1  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 
1743 aa  96.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
1765 aa  96.3  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  26.1 
 
 
459 aa  94.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  36.42 
 
 
1838 aa  94.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.96 
 
 
1861 aa  94.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.36 
 
 
1711 aa  93.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.25 
 
 
1723 aa  93.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 
1741 aa  92.8  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.19 
 
 
1711 aa  92.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.06 
 
 
1695 aa  92.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.99 
 
 
1698 aa  91.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  34.55 
 
 
1704 aa  91.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 
2213 aa  90.1  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.85 
 
 
2099 aa  88.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.79 
 
 
1672 aa  82.8  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.72 
 
 
1489 aa  77.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  33.93 
 
 
2224 aa  75.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
685 aa  73.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  48.19 
 
 
2087 aa  72.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.26 
 
 
2082 aa  72.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 
740 aa  69.7  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  43.81 
 
 
2125 aa  69.3  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.38 
 
 
739 aa  68.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.96 
 
 
803 aa  68.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  43.82 
 
 
2124 aa  67.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  36.45 
 
 
321 aa  65.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
764 aa  62.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.53 
 
 
762 aa  62.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  29.55 
 
 
815 aa  62  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.39 
 
 
941 aa  60.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.38 
 
 
902 aa  60.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.73 
 
 
744 aa  59.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.37 
 
 
959 aa  59.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  29.2 
 
 
912 aa  59.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.39 
 
 
812 aa  59.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.34 
 
 
744 aa  58.9  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  35.42 
 
 
797 aa  58.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.86 
 
 
780 aa  58.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.64 
 
 
861 aa  57  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.36 
 
 
751 aa  56.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  25.9 
 
 
1528 aa  56.2  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
815 aa  56.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
790 aa  56.2  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.08 
 
 
753 aa  56.2  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.7 
 
 
815 aa  55.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.53 
 
 
962 aa  55.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  37.89 
 
 
986 aa  55.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
768 aa  55.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.24 
 
 
739 aa  55.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.61 
 
 
897 aa  55.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.29 
 
 
685 aa  55.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.99 
 
 
744 aa  55.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.89 
 
 
1053 aa  54.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
738 aa  54.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.05 
 
 
807 aa  54.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
773 aa  54.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.96 
 
 
815 aa  55.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.96 
 
 
896 aa  54.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 
751 aa  54.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.35 
 
 
778 aa  53.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.96 
 
 
807 aa  54.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>