More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1423 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.74 
 
 
1734 aa  819    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.22 
 
 
1698 aa  840    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  30.65 
 
 
1704 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 
1723 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.89 
 
 
1711 aa  948    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.8 
 
 
1711 aa  875    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.99 
 
 
1695 aa  983    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.28 
 
 
1722 aa  811    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
1754 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 
1743 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 
1770 aa  852    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  97.85 
 
 
1719 aa  3498    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.45 
 
 
1725 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
1741 aa  834    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.05 
 
 
1672 aa  885    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.49 
 
 
1765 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1723 aa  3571    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.66 
 
 
1764 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  26.78 
 
 
1838 aa  417  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.56 
 
 
1525 aa  165  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  38.6 
 
 
321 aa  164  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.41 
 
 
1542 aa  149  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.37 
 
 
1543 aa  147  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.37 
 
 
1543 aa  147  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
1602 aa  146  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  35.86 
 
 
2087 aa  142  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
1607 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
1589 aa  137  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30 
 
 
1561 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  27.84 
 
 
1578 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.98 
 
 
2082 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
2136 aa  126  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.06 
 
 
1861 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
2099 aa  121  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  25.66 
 
 
2125 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  28.49 
 
 
2093 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  35.89 
 
 
2224 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
2213 aa  117  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.93 
 
 
2113 aa  116  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  34.05 
 
 
2113 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
2113 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  32.32 
 
 
2124 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
2113 aa  112  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
2120 aa  109  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  34.97 
 
 
912 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  40.97 
 
 
2097 aa  100  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  31.75 
 
 
2104 aa  98.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
2104 aa  98.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.75 
 
 
2104 aa  98.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.7 
 
 
2104 aa  98.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.48 
 
 
685 aa  97.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
1741 aa  97.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.14 
 
 
941 aa  96.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 
1740 aa  96.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  26.32 
 
 
2106 aa  95.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
897 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 
1198 aa  94  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  34.32 
 
 
1784 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
959 aa  93.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.14 
 
 
962 aa  92.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
1053 aa  91.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.82 
 
 
1787 aa  90.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  28.44 
 
 
986 aa  88.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
973 aa  88.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.37 
 
 
803 aa  88.6  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 
764 aa  87  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.74 
 
 
807 aa  86.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.43 
 
 
972 aa  85.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.49 
 
 
744 aa  83.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 
744 aa  83.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.61 
 
 
744 aa  82.8  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.54 
 
 
759 aa  82.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  27.35 
 
 
1210 aa  80.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.14 
 
 
762 aa  80.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  35.46 
 
 
1422 aa  80.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  36.5 
 
 
1780 aa  80.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 
739 aa  79.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 
790 aa  79.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  35.29 
 
 
1878 aa  79.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  31.55 
 
 
905 aa  79  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.35 
 
 
752 aa  79  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  33.14 
 
 
815 aa  79  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  26.9 
 
 
758 aa  78.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.81 
 
 
758 aa  77.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
815 aa  76.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.36 
 
 
815 aa  76.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.49 
 
 
789 aa  76.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  31.72 
 
 
865 aa  74.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.73 
 
 
751 aa  74.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.67 
 
 
1759 aa  74.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.04 
 
 
1948 aa  73.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 
740 aa  73.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.32 
 
 
911 aa  73.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.1 
 
 
876 aa  72.4  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
751 aa  71.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
764 aa  70.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.45 
 
 
1086 aa  71.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  31.1 
 
 
833 aa  71.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
685 aa  71.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
744 aa  70.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>