241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3298 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  92.53 
 
 
1740 aa  3369    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.93 
 
 
1787 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 
1759 aa  942    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1741 aa  3622    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  28.36 
 
 
1784 aa  261  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  37.38 
 
 
2097 aa  232  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.9 
 
 
1589 aa  228  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  24.61 
 
 
1878 aa  201  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.87 
 
 
1780 aa  192  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.3 
 
 
1607 aa  186  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.08 
 
 
1948 aa  180  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.08 
 
 
2104 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.99 
 
 
2093 aa  177  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.23 
 
 
2104 aa  177  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.51 
 
 
1525 aa  175  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  23.94 
 
 
2104 aa  174  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
1602 aa  167  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.76 
 
 
1542 aa  160  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.46 
 
 
2104 aa  160  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  25.65 
 
 
1422 aa  157  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.4 
 
 
1543 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.4 
 
 
1543 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.78 
 
 
1561 aa  147  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  26.94 
 
 
1578 aa  146  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  24.42 
 
 
2106 aa  145  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.56 
 
 
2120 aa  141  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.57 
 
 
2213 aa  124  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.76 
 
 
1698 aa  122  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  23.51 
 
 
1838 aa  113  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.06 
 
 
685 aa  111  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.68 
 
 
1764 aa  108  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.46 
 
 
1861 aa  105  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.46 
 
 
1723 aa  103  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  26.71 
 
 
459 aa  100  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.91 
 
 
1725 aa  100  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
1734 aa  99.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.71 
 
 
2099 aa  97.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
1719 aa  97.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
1723 aa  97.1  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
1741 aa  96.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.33 
 
 
1722 aa  93.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
1743 aa  91.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
1754 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.67 
 
 
1770 aa  90.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.84 
 
 
1711 aa  90.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
1765 aa  89  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  21.98 
 
 
2087 aa  88.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.38 
 
 
1711 aa  87.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  34.04 
 
 
1704 aa  86.7  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.95 
 
 
1695 aa  85.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 
2136 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.71 
 
 
2113 aa  81.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
2113 aa  81.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
2113 aa  81.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  34.71 
 
 
2113 aa  81.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.58 
 
 
1672 aa  77.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.79 
 
 
2082 aa  68.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  30.82 
 
 
2224 aa  67.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.79 
 
 
756 aa  65.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.56 
 
 
739 aa  62.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  30.34 
 
 
2124 aa  62.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 
773 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
744 aa  60.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  23.83 
 
 
1528 aa  60.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
768 aa  59.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
764 aa  59.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  40.7 
 
 
2125 aa  58.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.07 
 
 
780 aa  57.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
751 aa  57.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
815 aa  56.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  25.9 
 
 
1475 aa  55.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
986 aa  56.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.19 
 
 
1489 aa  56.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.21 
 
 
753 aa  55.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  30.84 
 
 
436 aa  55.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  27.7 
 
 
797 aa  55.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
740 aa  55.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
759 aa  54.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  36.25 
 
 
1321 aa  54.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
744 aa  53.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
762 aa  53.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
744 aa  53.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.68 
 
 
941 aa  53.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  25.27 
 
 
906 aa  52.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  30.56 
 
 
560 aa  52.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  31.58 
 
 
758 aa  52.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.62 
 
 
812 aa  52  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
897 aa  52  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1437  DEAD/DEAH box helicase-like  34.78 
 
 
446 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.67 
 
 
937 aa  52  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.76 
 
 
634 aa  51.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  25.89 
 
 
905 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.38 
 
 
1198 aa  51.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 
758 aa  51.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.03 
 
 
752 aa  52  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  22.55 
 
 
764 aa  50.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.42 
 
 
781 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  37.93 
 
 
912 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.76 
 
 
775 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81007  predicted protein  40 
 
 
558 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.661709  normal  0.655952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>