More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4799 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.95 
 
 		 807 aa  828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.46 
 
 		 761 aa  698    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.17 
 
 		 763 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.45 
 
 		 802 aa  735    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  52.83 
 
 		 804 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.94 
 
 		 807 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.09 
 
 		 848 aa  730    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  51.19 
 
 		 865 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.71 
 
 		 824 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 		 775 aa  1547    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.17 
 
 		 861 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  45.19 
 
 		 891 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.74 
 
 		 804 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.79 
 
 		 790 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  58.5 
 
 		 798 aa  847    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.87 
 
 		 775 aa  911    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.84 
 
 		 778 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.62 
 
 		 815 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 775 aa  1547    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.01 
 
 		 782 aa  1257    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  50 
 
 		 795 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.56 
 
 		 812 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.36 
 
 		 815 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.4 
 
 		 764 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  76.55 
 
 		 771 aa  1167    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99.23 
 
 		 775 aa  1535    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.87 
 
 		 781 aa  1296    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.04 
 
 		 806 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  47.39 
 
 		 833 aa  662    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  62.16 
 
 		 795 aa  940    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.4 
 
 		 868 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  48.08 
 
 		 780 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 		 803 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  45.63 
 
 		 866 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.28 
 
 		 764 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.82 
 
 		 764 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.16 
 
 		 764 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  44.97 
 
 		 862 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.75 
 
 		 868 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  42.31 
 
 		 761 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  37.78 
 
 		 912 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.52 
 
 		 773 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  38.35 
 
 		 986 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.36 
 
 		 739 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.96 
 
 		 962 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  37.79 
 
 		 751 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.84 
 
 		 768 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.07 
 
 		 1053 aa  466  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 		 764 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.29 
 
 		 762 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  40.5 
 
 		 797 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.23 
 
 		 973 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.21 
 
 		 753 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 		 959 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.5 
 
 		 941 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.54 
 
 		 902 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.87 
 
 		 1198 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 		 972 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.03 
 
 		 1086 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 		 738 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.11 
 
 		 807 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.29 
 
 		 752 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 		 758 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.99 
 
 		 751 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.33 
 
 		 759 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.07 
 
 		 896 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.03 
 
 		 789 aa  399  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.95 
 
 		 790 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 		 808 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  33.84 
 
 		 815 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  32.75 
 
 		 1210 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 		 685 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.23 
 
 		 805 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 		 829 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  32.91 
 
 		 831 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.22 
 
 		 838 aa  346  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 		 855 aa  318  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  32.68 
 
 		 758 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 		 803 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.54 
 
 		 1178 aa  286  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 		 744 aa  280  8e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 897 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.48 
 
 		 766 aa  271  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 756 aa  271  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.38 
 
 		 744 aa  266  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  30.9 
 
 		 948 aa  260  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  30.14 
 
 		 931 aa  260  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 		 744 aa  260  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 751 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.26 
 
 		 744 aa  246  8e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.41 
 
 		 739 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 		 815 aa  226  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  22.67 
 
 		 905 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.62 
 
 		 914 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  24.46 
 
 		 906 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.36 
 
 		 911 aa  180  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.7 
 
 		 876 aa  177  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.96 
 
 		 879 aa  167  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2740  helicase domain-containing protein  45.27 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>