120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4387 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  30.55 
 
 		 1475 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  36.98 
 
 		 1528 aa  742    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 1489 aa  2955    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1838 aa  79  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.85 
 
 		 1764 aa  77  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.28 
 
 		 2093 aa  72  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  24.84 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  26.02 
 
 		 941 aa  65.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.39 
 
 		 2113 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.74 
 
 		 931 aa  63.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 2113 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.96 
 
 		 1561 aa  63.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.75 
 
 		 1602 aa  63.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  26.51 
 
 		 2113 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 		 2113 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 2099 aa  62  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  25.65 
 
 		 915 aa  61.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  26.69 
 
 		 914 aa  61.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  23.64 
 
 		 1578 aa  60.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 927 aa  60.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.36 
 
 		 2213 aa  60.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  27.72 
 
 		 2097 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  23.81 
 
 		 870 aa  60.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 1589 aa  60.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.18 
 
 		 1787 aa  60.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  23.96 
 
 		 1235 aa  59.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 1759 aa  59.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  25.62 
 
 		 2106 aa  58.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.32 
 
 		 1723 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.62 
 
 		 928 aa  58.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  24.24 
 
 		 1523 aa  57.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.04 
 
 		 1740 aa  57.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 		 1698 aa  56.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.83 
 
 		 2136 aa  56.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.19 
 
 		 1741 aa  56.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  28.94 
 
 		 2125 aa  55.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 1539 aa  55.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  23.47 
 
 		 1254 aa  54.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  22.83 
 
 		 1071 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 815 aa  53.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1429 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  25.65 
 
 		 946 aa  53.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.23 
 
 		 916 aa  53.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.38 
 
 		 905 aa  53.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 1451 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.22 
 
 		 1722 aa  53.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.55 
 
 		 879 aa  53.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  24.92 
 
 		 874 aa  52.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 		 1770 aa  53.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  27.62 
 
 		 2082 aa  53.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 928 aa  52.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.37 
 
 		 2104 aa  52.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.02 
 
 		 1734 aa  52.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  18.67 
 
 		 906 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  26.05 
 
 		 1434 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.48 
 
 		 1672 aa  51.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  25.38 
 
 		 2087 aa  51.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  23.17 
 
 		 1062 aa  51.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.89 
 
 		 1741 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1514 aa  51.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.37 
 
 		 2104 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 815 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.3 
 
 		 888 aa  50.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  25.8 
 
 		 872 aa  50.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  28.57 
 
 		 2104 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.21 
 
 		 1743 aa  49.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.1 
 
 		 744 aa  49.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.64 
 
 		 1523 aa  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 937 aa  49.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.09 
 
 		 914 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.65 
 
 		 868 aa  49.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 973 aa  49.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.8 
 
 		 738 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  21.02 
 
 		 874 aa  49.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  21.34 
 
 		 874 aa  48.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 1695 aa  48.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.96 
 
 		 1561 aa  48.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  34.86 
 
 		 986 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 763 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  34.07 
 
 		 1704 aa  48.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  36.62 
 
 		 954 aa  47.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  25.32 
 
 		 1523 aa  47.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.32 
 
 		 1523 aa  47.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 1711 aa  47.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 1525 aa  47.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 		 972 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 911 aa  47.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.51 
 
 		 1719 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.42 
 
 		 698 aa  46.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  26.32 
 
 		 1784 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.35 
 
 		 694 aa  47  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.35 
 
 		 803 aa  47  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.51 
 
 		 1723 aa  46.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  24.48 
 
 		 1729 aa  47  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0592  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 1458 aa  47  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.3 
 
 		 962 aa  47  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  31.3 
 
 		 925 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.8 
 
 		 933 aa  46.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 756 aa  46.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>