35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0350 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  100 
 
 		 1062 aa  2166    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  37.13 
 
 		 1323 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  37.08 
 
 		 1285 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  35.32 
 
 		 1101 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  35.68 
 
 		 1159 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  38.74 
 
 		 1188 aa  589  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  36.72 
 
 		 1332 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  37.35 
 
 		 1131 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  36.34 
 
 		 1339 aa  581  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  36.69 
 
 		 1173 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  36.89 
 
 		 1321 aa  569  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  36.47 
 
 		 1071 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  34.8 
 
 		 1215 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  34.56 
 
 		 1063 aa  512  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  34.85 
 
 		 1287 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  34.36 
 
 		 1226 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  33.11 
 
 		 1252 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 1220 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  32.49 
 
 		 1220 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 1235 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  33.66 
 
 		 1314 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  37.39 
 
 		 1374 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  32.16 
 
 		 1254 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 1162 aa  452  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.34 
 
 		 1201 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  27.28 
 
 		 1401 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  27.28 
 
 		 1401 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1410 aa  212  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 1189 aa  209  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  25.07 
 
 		 1082 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  28.1 
 
 		 1424 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.17 
 
 		 1489 aa  51.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.58 
 
 		 876 aa  48.5  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.54 
 
 		 879 aa  48.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.93 
 
 		 1672 aa  45.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>