34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2728 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  39.89 
 
 		 1332 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  100 
 
 		 1314 aa  2658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  44.21 
 
 		 1252 aa  851    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  44.21 
 
 		 1254 aa  865    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  63.21 
 
 		 1287 aa  1545    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  57.54 
 
 		 1226 aa  1290    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  41.79 
 
 		 1323 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  40.8 
 
 		 1321 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  39.01 
 
 		 1339 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  45.31 
 
 		 1220 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  46.66 
 
 		 1235 aa  929    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  40.79 
 
 		 1285 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  62.68 
 
 		 1374 aa  1447    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  45.31 
 
 		 1220 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.35 
 
 		 1188 aa  621  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  36.22 
 
 		 1159 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  34.18 
 
 		 1131 aa  543  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  32.62 
 
 		 1101 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  33.74 
 
 		 1062 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  32.27 
 
 		 1173 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  30.92 
 
 		 1071 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  33.3 
 
 		 1215 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  30.7 
 
 		 1063 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  31.73 
 
 		 1162 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  30.42 
 
 		 1201 aa  246  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 1401 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  27.41 
 
 		 1401 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  25.63 
 
 		 1424 aa  191  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.19 
 
 		 1189 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 1410 aa  134  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.14 
 
 		 1082 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 1542 aa  50.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11989  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  45.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>