35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0220 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  52.44 
 
 		 1410 aa  1413    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  38.38 
 
 		 1424 aa  811    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  100 
 
 		 1401 aa  2881    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1401 aa  2881    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1201 aa  342  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 1189 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  27.28 
 
 		 1062 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  27.53 
 
 		 1131 aa  236  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  25.8 
 
 		 1101 aa  233  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  26.32 
 
 		 1323 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.97 
 
 		 1082 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1188 aa  210  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  28.59 
 
 		 1285 aa  207  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  26.81 
 
 		 1220 aa  207  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 		 1220 aa  207  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  25.83 
 
 		 1332 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1339 aa  197  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  28.74 
 
 		 1159 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  27 
 
 		 1071 aa  195  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  26.21 
 
 		 1252 aa  194  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  25.75 
 
 		 1063 aa  194  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  27 
 
 		 1226 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  28.57 
 
 		 1314 aa  191  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  26.61 
 
 		 1173 aa  191  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  26.83 
 
 		 1254 aa  190  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1321 aa  190  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  28.05 
 
 		 1287 aa  188  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  24.31 
 
 		 1215 aa  181  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 1235 aa  178  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  27.43 
 
 		 1374 aa  172  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32 
 
 		 1162 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 897 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.61 
 
 		 595 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2740  helicase domain-containing protein  33.8 
 
 		 468 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.47 
 
 		 505 aa  45.8  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>