32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3760 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1201 aa  2485    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  31.43 
 
 		 1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  30.15 
 
 		 1401 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1401 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  28.59 
 
 		 1082 aa  326  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  30.84 
 
 		 1410 aa  323  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  29.59 
 
 		 1101 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  25.61 
 
 		 1424 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  29.74 
 
 		 1323 aa  274  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  32.57 
 
 		 1159 aa  271  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  29.34 
 
 		 1062 aa  269  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  31.57 
 
 		 1188 aa  261  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  29.97 
 
 		 1287 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  28.82 
 
 		 1131 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1285 aa  248  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  29.38 
 
 		 1226 aa  247  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  30.64 
 
 		 1314 aa  245  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  28.26 
 
 		 1332 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  31.22 
 
 		 1374 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1235 aa  243  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  30.53 
 
 		 1071 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 		 1321 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1339 aa  239  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  29.82 
 
 		 1254 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 1220 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  30.03 
 
 		 1220 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  27.57 
 
 		 1215 aa  234  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  29.28 
 
 		 1252 aa  227  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  28.7 
 
 		 1063 aa  216  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  27.78 
 
 		 1173 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  30.21 
 
 		 1162 aa  195  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  32.38 
 
 		 939 aa  46.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>