45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1966 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1162 aa  2348    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  35.76 
 
 		 1173 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  32.62 
 
 		 1062 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  31.81 
 
 		 1323 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  31.6 
 
 		 1215 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 1339 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 1285 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  31.68 
 
 		 1332 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 1321 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 1188 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  32.37 
 
 		 1101 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  33 
 
 		 1159 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  33.36 
 
 		 1131 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  31.92 
 
 		 1287 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  31.48 
 
 		 1063 aa  389  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1220 aa  383  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  30.94 
 
 		 1220 aa  383  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 1235 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  32.49 
 
 		 1226 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  32.21 
 
 		 1254 aa  360  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  30.98 
 
 		 1252 aa  356  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  31.65 
 
 		 1314 aa  352  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  33.44 
 
 		 1374 aa  352  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  29.57 
 
 		 1071 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1201 aa  219  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1189 aa  188  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  26.75 
 
 		 1401 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  26.75 
 
 		 1401 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  26.46 
 
 		 1424 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  23.81 
 
 		 1082 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 1410 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  23.67 
 
 		 751 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 2213 aa  48.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  25.29 
 
 		 655 aa  47.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1661  putative ATP-dependent RNA helicase  23.47 
 
 		 441 aa  46.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.09 
 
 		 515 aa  45.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.09 
 
 		 515 aa  45.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1426 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.51 
 
 		 861 aa  45.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1429 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.4 
 
 		 911 aa  44.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  25.29 
 
 		 651 aa  44.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  25.29 
 
 		 651 aa  44.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  25.29 
 
 		 651 aa  44.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.73 
 
 		 1743 aa  44.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>