35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0466 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  41.43 
 
 		 1332 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  56.67 
 
 		 1314 aa  1283    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  42.88 
 
 		 1252 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  42.37 
 
 		 1254 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  58.33 
 
 		 1287 aa  1300    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  100 
 
 		 1226 aa  2470    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  41.87 
 
 		 1323 aa  807    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  41.86 
 
 		 1321 aa  781    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  40.19 
 
 		 1339 aa  753    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  44.26 
 
 		 1220 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  44.41 
 
 		 1235 aa  835    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  40.83 
 
 		 1285 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  56.39 
 
 		 1374 aa  1274    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  44.26 
 
 		 1220 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.39 
 
 		 1188 aa  602  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  35.99 
 
 		 1131 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  35.57 
 
 		 1159 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  33.92 
 
 		 1101 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  34.22 
 
 		 1062 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  32.64 
 
 		 1071 aa  466  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  33.57 
 
 		 1173 aa  466  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  33.66 
 
 		 1063 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  33.73 
 
 		 1215 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1162 aa  350  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 1201 aa  252  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  27.32 
 
 		 1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 1189 aa  180  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.25 
 
 		 1424 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  23.87 
 
 		 1082 aa  171  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  30.57 
 
 		 1410 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  32.37 
 
 		 133 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 1542 aa  51.6  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  33.73 
 
 		 822 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.63 
 
 		 1489 aa  45.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>