14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11976 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  276  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  67.91 
 
 
1235 aa  192  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  58.12 
 
 
1252 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  50 
 
 
1254 aa  127  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  47.15 
 
 
1220 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  47.15 
 
 
1220 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  38.89 
 
 
1314 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  37.21 
 
 
1287 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  32.37 
 
 
1226 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  30.83 
 
 
1374 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  30.08 
 
 
1285 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  26.72 
 
 
1323 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  35.85 
 
 
1215 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  30.21 
 
 
1159 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>