33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0829 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  39.25 
 
 
1321 aa  722    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  45.31 
 
 
1314 aa  868    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  50.85 
 
 
1252 aa  1110    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  52.08 
 
 
1254 aa  1099    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  45.09 
 
 
1287 aa  879    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  44.26 
 
 
1226 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  39.53 
 
 
1323 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  39.97 
 
 
1332 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  39.43 
 
 
1339 aa  724    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1220 aa  2501    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  53.54 
 
 
1235 aa  1153    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  40 
 
 
1285 aa  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  44.06 
 
 
1374 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  100 
 
 
1220 aa  2501    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  34.44 
 
 
1188 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  34.07 
 
 
1159 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  34.29 
 
 
1101 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  33.78 
 
 
1131 aa  536  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  32.41 
 
 
1062 aa  476  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  32.73 
 
 
1173 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  34.24 
 
 
1063 aa  446  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  30.02 
 
 
1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  30.76 
 
 
1215 aa  403  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  30.75 
 
 
1162 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 
1201 aa  238  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  26.81 
 
 
1401 aa  207  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 
1401 aa  207  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  26.94 
 
 
1189 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.36 
 
 
1424 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.57 
 
 
1082 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
1410 aa  148  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  47.15 
 
 
133 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11989  hypothetical protein  51.11 
 
 
164 aa  48.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>