31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1184 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  81 
 
 
1339 aa  2234    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  40.54 
 
 
1314 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  40.58 
 
 
1252 aa  708    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  38.97 
 
 
1254 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  41.68 
 
 
1287 aa  806    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  41.86 
 
 
1226 aa  773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  48.56 
 
 
1323 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
1188 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  91.3 
 
 
1332 aa  2472    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1321 aa  2709    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  39.25 
 
 
1220 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  39.64 
 
 
1235 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  60.42 
 
 
1285 aa  1519    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  40.58 
 
 
1374 aa  731    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  39.25 
 
 
1220 aa  722    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  35.84 
 
 
1131 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  36.65 
 
 
1101 aa  582  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  36.05 
 
 
1159 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  36.61 
 
 
1062 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  35.24 
 
 
1173 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  33.86 
 
 
1071 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  33.36 
 
 
1063 aa  446  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  32.38 
 
 
1215 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  31.78 
 
 
1162 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
1201 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.45 
 
 
1189 aa  193  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  25.99 
 
 
1401 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  25.99 
 
 
1401 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.56 
 
 
1082 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  25.27 
 
 
1424 aa  164  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  24.96 
 
 
1410 aa  155  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>