32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1056 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  100 
 
 
1063 aa  2201    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  34.47 
 
 
1062 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  32.82 
 
 
1101 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
1188 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  34.55 
 
 
1173 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  33.3 
 
 
1339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  33.06 
 
 
1071 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  33.67 
 
 
1323 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  34.05 
 
 
1220 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  34.8 
 
 
1215 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  32.68 
 
 
1332 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
1220 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  33.36 
 
 
1321 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
1285 aa  452  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  33.75 
 
 
1226 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  35.33 
 
 
1159 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  36.15 
 
 
1131 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  31.26 
 
 
1287 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  32.25 
 
 
1235 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  30.95 
 
 
1254 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  32.68 
 
 
1252 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  30.7 
 
 
1314 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.56 
 
 
1162 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  33.22 
 
 
1374 aa  362  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 
1201 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  25.75 
 
 
1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  25.75 
 
 
1401 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
1189 aa  178  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
1410 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  23.73 
 
 
1082 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.85 
 
 
1424 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.96 
 
 
763 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>