44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4101 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  100 
 
 		 1071 aa  2230    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  35.03 
 
 		 1062 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  33.46 
 
 		 1101 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 1188 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  31.64 
 
 		 1159 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1285 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  33.25 
 
 		 1131 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  34.22 
 
 		 1339 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  33.06 
 
 		 1173 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  32.64 
 
 		 1226 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  32.12 
 
 		 1323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  32.96 
 
 		 1063 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  32.09 
 
 		 1287 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  33.83 
 
 		 1332 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  33.86 
 
 		 1321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  34.62 
 
 		 1374 aa  429  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  35.06 
 
 		 1215 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  31.39 
 
 		 1314 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  29.35 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  28.41 
 
 		 1254 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  28.58 
 
 		 1252 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1235 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 1162 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 		 1201 aa  242  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  26.19 
 
 		 1082 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 1401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  27 
 
 		 1401 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 1189 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 1410 aa  165  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  26.48 
 
 		 1424 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.83 
 
 		 1489 aa  53.5  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.81 
 
 		 879 aa  51.6  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 1542 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  27.42 
 
 		 2093 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.61 
 
 		 1607 aa  49.3  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 1525 aa  48.9  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.59 
 
 		 1561 aa  48.9  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.16 
 
 		 739 aa  47  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  20.13 
 
 		 906 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 2213 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  28.18 
 
 		 2087 aa  46.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.45 
 
 		 1723 aa  44.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 1719 aa  44.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>