32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1514 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  100 
 
 
1082 aa  2229    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  28.59 
 
 
1201 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
1189 aa  268  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  27.19 
 
 
1410 aa  214  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  24.97 
 
 
1401 aa  214  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  24.97 
 
 
1401 aa  214  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  26.19 
 
 
1071 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  27.59 
 
 
1101 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  26.65 
 
 
1188 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  24.15 
 
 
1252 aa  195  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  26.24 
 
 
1323 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  24.74 
 
 
1173 aa  188  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  24.38 
 
 
1215 aa  187  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  25.07 
 
 
1062 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  25.5 
 
 
1285 aa  183  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  23.93 
 
 
1424 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  24.75 
 
 
1339 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  25.68 
 
 
1332 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  24.56 
 
 
1321 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  23.96 
 
 
1254 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  23.48 
 
 
1063 aa  171  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  24.57 
 
 
1220 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  22.94 
 
 
1235 aa  170  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  24.57 
 
 
1220 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  23.87 
 
 
1226 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  24.85 
 
 
1374 aa  164  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  24.51 
 
 
1131 aa  159  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  25.37 
 
 
1159 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  23.89 
 
 
1287 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  25.77 
 
 
1314 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  24.8 
 
 
1162 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  36.62 
 
 
905 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>