34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0226 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  71.59 
 
 
1159 aa  1652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  37.65 
 
 
1323 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  100 
 
 
1131 aa  2321    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  35.69 
 
 
1332 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  36.66 
 
 
1188 aa  612  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  35.89 
 
 
1339 aa  601  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
1285 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  37.58 
 
 
1062 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  35.84 
 
 
1321 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  35.58 
 
 
1101 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  35.96 
 
 
1226 aa  568  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  35.71 
 
 
1287 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  34.79 
 
 
1235 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  33.86 
 
 
1220 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  33.86 
 
 
1220 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  33.87 
 
 
1254 aa  539  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  34.19 
 
 
1374 aa  539  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  34.42 
 
 
1314 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  33.85 
 
 
1252 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  33.07 
 
 
1071 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  35.58 
 
 
1173 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  31.83 
 
 
1215 aa  423  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  35.88 
 
 
1063 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
1162 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 
1201 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  27.53 
 
 
1401 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
1401 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.09 
 
 
1424 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 
1410 aa  194  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 
1189 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.51 
 
 
1082 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1217  protein of unknown function DUF450  26.9 
 
 
1042 aa  46.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  28.93 
 
 
795 aa  45.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.33 
 
 
775 aa  45.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>