39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  44.21 
 
 		 1314 aa  847    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  38.97 
 
 		 1321 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  37.94 
 
 		 1339 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  39.29 
 
 		 1332 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  52.08 
 
 		 1220 aa  1099    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  57.63 
 
 		 1235 aa  1347    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  39.43 
 
 		 1285 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  38.76 
 
 		 1323 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  42.43 
 
 		 1226 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  52.08 
 
 		 1220 aa  1099    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  44.62 
 
 		 1287 aa  867    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  100 
 
 		 1254 aa  2551    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  69.1 
 
 		 1252 aa  1683    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  43.08 
 
 		 1374 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 1188 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  33.45 
 
 		 1101 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  33.12 
 
 		 1159 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  33.63 
 
 		 1131 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  32.16 
 
 		 1062 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  32.94 
 
 		 1173 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  28.25 
 
 		 1071 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  31.97 
 
 		 1215 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  30.95 
 
 		 1063 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 1162 aa  335  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 		 1201 aa  237  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  26.83 
 
 		 1401 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  26.83 
 
 		 1401 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  25.86 
 
 		 1189 aa  184  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  23.96 
 
 		 1082 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  26.69 
 
 		 1424 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  127  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 		 1410 aa  127  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11989  hypothetical protein  48.48 
 
 		 164 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.47 
 
 		 1489 aa  54.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 2113 aa  49.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1542 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.71 
 
 		 2113 aa  47  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  33.71 
 
 		 2113 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.71 
 
 		 2113 aa  46.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>