36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2653 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  100 
 
 
1173 aa  2396    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  38.22 
 
 
1215 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  36.23 
 
 
1062 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
1162 aa  538  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  35.31 
 
 
1323 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  33.68 
 
 
1188 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  34.84 
 
 
1101 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  38.07 
 
 
1285 aa  495  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  34.62 
 
 
1339 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  34.84 
 
 
1332 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  32.4 
 
 
1321 aa  482  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  34.65 
 
 
1063 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  32.97 
 
 
1220 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 
1220 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  34.88 
 
 
1131 aa  469  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  33.57 
 
 
1226 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  32.67 
 
 
1071 aa  459  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  33.73 
 
 
1252 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  35.73 
 
 
1235 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  34.07 
 
 
1159 aa  446  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  32.94 
 
 
1254 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  30.31 
 
 
1374 aa  435  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  32.27 
 
 
1314 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  33.19 
 
 
1287 aa  420  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
1201 aa  214  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  25.79 
 
 
1410 aa  202  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 
1189 aa  199  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  26.61 
 
 
1401 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  26.61 
 
 
1401 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.74 
 
 
1082 aa  188  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  27.99 
 
 
1424 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 
1672 aa  49.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.12 
 
 
1770 aa  48.9  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.56 
 
 
1602 aa  48.9  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  31.37 
 
 
1838 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  28.4 
 
 
1780 aa  46.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>