34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1415 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  38.38 
 
 		 1173 aa  715    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  100 
 
 		 1215 aa  2525    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  35.88 
 
 		 1062 aa  522  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 1188 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  34.38 
 
 		 1101 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  34.18 
 
 		 1285 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  34.8 
 
 		 1063 aa  449  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  32.79 
 
 		 1323 aa  443  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  32.74 
 
 		 1332 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  32.15 
 
 		 1339 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  32.38 
 
 		 1321 aa  435  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.78 
 
 		 1162 aa  433  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  35.06 
 
 		 1071 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  33.65 
 
 		 1131 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  32.16 
 
 		 1159 aa  420  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  32.08 
 
 		 1287 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  30.76 
 
 		 1220 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  30.76 
 
 		 1220 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  33.6 
 
 		 1226 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  31.97 
 
 		 1254 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  32.21 
 
 		 1252 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1235 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  33.3 
 
 		 1314 aa  376  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  32.42 
 
 		 1374 aa  376  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1201 aa  235  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  26.95 
 
 		 1189 aa  190  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.38 
 
 		 1082 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  24.31 
 
 		 1401 aa  181  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 		 1401 aa  181  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 		 1410 aa  133  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  24.53 
 
 		 1424 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 2213 aa  49.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  37.14 
 
 		 1784 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 1542 aa  46.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>