More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1124 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 
1561 aa  3138    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.16 
 
 
1542 aa  1653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.7 
 
 
1607 aa  1009    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.66 
 
 
1543 aa  1327    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.05 
 
 
1525 aa  1186    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.51 
 
 
1589 aa  707    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  30.43 
 
 
1578 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 
1543 aa  1327    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.98 
 
 
1602 aa  1007    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  28.75 
 
 
2093 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  27.49 
 
 
1784 aa  400  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.17 
 
 
1764 aa  307  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  27.02 
 
 
1838 aa  276  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.96 
 
 
1861 aa  259  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.77 
 
 
1787 aa  204  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
2104 aa  181  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.99 
 
 
2104 aa  179  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.41 
 
 
2120 aa  178  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 
2113 aa  178  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  26.92 
 
 
2104 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
1711 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
2099 aa  177  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.53 
 
 
2113 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  32.53 
 
 
2113 aa  174  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.2 
 
 
1698 aa  173  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.43 
 
 
2113 aa  173  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 
1722 aa  172  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 
1741 aa  168  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.37 
 
 
1759 aa  166  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.51 
 
 
1734 aa  164  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 
1422 aa  164  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.42 
 
 
2104 aa  162  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1743 aa  156  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.37 
 
 
1711 aa  154  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.97 
 
 
1740 aa  154  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.84 
 
 
1725 aa  153  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  27.27 
 
 
2106 aa  152  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  44.5 
 
 
2224 aa  151  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.78 
 
 
2136 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  35.06 
 
 
1704 aa  150  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.08 
 
 
1770 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.73 
 
 
1672 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  28.65 
 
 
2087 aa  149  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.21 
 
 
1723 aa  149  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.86 
 
 
1754 aa  148  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.93 
 
 
1741 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
1765 aa  145  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  35.05 
 
 
2082 aa  141  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
1695 aa  138  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
685 aa  137  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  25.63 
 
 
2125 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.16 
 
 
2213 aa  132  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  35.74 
 
 
2124 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
1719 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 
1723 aa  130  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  26.7 
 
 
1780 aa  125  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  24.56 
 
 
1878 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  28.65 
 
 
459 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.42 
 
 
1948 aa  116  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  33.47 
 
 
321 aa  109  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  32.18 
 
 
2097 aa  105  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.11 
 
 
973 aa  95.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  31.44 
 
 
905 aa  95.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 
744 aa  93.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  29.29 
 
 
758 aa  92.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
815 aa  92.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.43 
 
 
962 aa  91.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.33 
 
 
739 aa  91.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 
744 aa  90.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
744 aa  89.4  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  34.78 
 
 
797 aa  86.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 
744 aa  86.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
959 aa  85.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 
1198 aa  85.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  33.64 
 
 
986 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.12 
 
 
972 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.1 
 
 
758 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.12 
 
 
759 aa  83.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.65 
 
 
751 aa  83.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.89 
 
 
815 aa  83.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  28.16 
 
 
815 aa  82.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  28.85 
 
 
1210 aa  82.4  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
1053 aa  82  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
764 aa  81.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  30 
 
 
912 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.37 
 
 
941 aa  78.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
937 aa  77.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 
768 aa  78.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.28 
 
 
752 aa  77.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
740 aa  77.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
762 aa  77  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.26 
 
 
1086 aa  76.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  31.94 
 
 
1321 aa  75.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 
928 aa  75.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.85 
 
 
803 aa  73.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.81 
 
 
753 aa  74.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 
928 aa  73.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
927 aa  74.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.53 
 
 
807 aa  73.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>