More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2038 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.43 
 
 
2104 aa  928    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  32.37 
 
 
2106 aa  978    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.35 
 
 
2104 aa  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  31.29 
 
 
2104 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
2120 aa  4410    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.9 
 
 
2104 aa  896    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  31.35 
 
 
1422 aa  579  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.13 
 
 
685 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.62 
 
 
1607 aa  309  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  23.2 
 
 
1784 aa  305  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  35.92 
 
 
459 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3653  hypothetical protein  30.29 
 
 
906 aa  270  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  26.92 
 
 
2093 aa  202  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.57 
 
 
1787 aa  184  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.41 
 
 
1561 aa  171  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  25.24 
 
 
2097 aa  170  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.48 
 
 
1525 aa  170  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.82 
 
 
1602 aa  152  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.47 
 
 
1740 aa  151  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.47 
 
 
1578 aa  150  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26 
 
 
1543 aa  149  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26 
 
 
1543 aa  149  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.18 
 
 
1542 aa  145  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.39 
 
 
1741 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 
2113 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  36.54 
 
 
2113 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.54 
 
 
2113 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 
2113 aa  135  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
1861 aa  135  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
2136 aa  135  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.93 
 
 
1780 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.68 
 
 
1759 aa  132  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.67 
 
 
1764 aa  131  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  24.3 
 
 
1878 aa  131  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  30.1 
 
 
2082 aa  129  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  37.16 
 
 
2224 aa  129  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
2099 aa  128  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.76 
 
 
1589 aa  128  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.16 
 
 
1672 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  33.46 
 
 
2087 aa  124  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  34.69 
 
 
2124 aa  123  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
2213 aa  123  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.77 
 
 
1698 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.22 
 
 
1734 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.09 
 
 
1711 aa  120  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.02 
 
 
1743 aa  120  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  36.29 
 
 
2125 aa  118  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.25 
 
 
1948 aa  115  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
1754 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  29.27 
 
 
1838 aa  115  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
1722 aa  113  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.5 
 
 
1723 aa  110  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.79 
 
 
1723 aa  109  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.46 
 
 
1770 aa  108  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 
1719 aa  108  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
1711 aa  105  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
1741 aa  104  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
1725 aa  103  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
1695 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 
1765 aa  99.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  28.04 
 
 
1704 aa  95.9  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.77 
 
 
744 aa  84.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
1053 aa  75.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
744 aa  74.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
744 aa  74.7  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.57 
 
 
815 aa  74.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.11 
 
 
1198 aa  72.8  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.4 
 
 
962 aa  71.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  28.97 
 
 
758 aa  70.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 
740 aa  70.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
751 aa  70.1  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.54 
 
 
876 aa  69.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
744 aa  69.7  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.38 
 
 
756 aa  69.3  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  27.36 
 
 
905 aa  68.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  25 
 
 
1210 aa  67.4  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  25.44 
 
 
751 aa  66.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.29 
 
 
739 aa  65.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.44 
 
 
762 aa  65.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.29 
 
 
706 aa  65.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.12 
 
 
736 aa  63.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 
746 aa  64.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.65 
 
 
759 aa  63.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.31 
 
 
758 aa  63.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  31.51 
 
 
321 aa  63.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  30.05 
 
 
797 aa  63.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.52 
 
 
755 aa  63.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.04 
 
 
764 aa  62.4  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  25.93 
 
 
986 aa  62  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
768 aa  62  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.22 
 
 
946 aa  62.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 
698 aa  61.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.69 
 
 
738 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  28.3 
 
 
1618 aa  61.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
716 aa  61.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0592  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 
1458 aa  61.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.64 
 
 
751 aa  60.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.63 
 
 
941 aa  60.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  47.69 
 
 
736 aa  60.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  24.37 
 
 
815 aa  60.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>