More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5807 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  34.58 
 
 
2106 aa  1107    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99 
 
 
2104 aa  4328    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.75 
 
 
2104 aa  919    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  98.91 
 
 
2104 aa  4338    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
2120 aa  913    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
2104 aa  4373    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
1422 aa  619  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.4 
 
 
685 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  38.24 
 
 
459 aa  262  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  23.89 
 
 
1784 aa  259  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3653  hypothetical protein  29.71 
 
 
906 aa  255  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.95 
 
 
2093 aa  204  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.07 
 
 
1561 aa  179  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.23 
 
 
1741 aa  177  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.02 
 
 
1607 aa  176  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.26 
 
 
1740 aa  176  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.43 
 
 
1602 aa  173  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
1542 aa  170  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.36 
 
 
1543 aa  168  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
1543 aa  168  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.83 
 
 
1787 aa  163  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 
1525 aa  163  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  26.59 
 
 
1578 aa  153  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.96 
 
 
1759 aa  143  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.07 
 
 
1589 aa  141  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  23.07 
 
 
1878 aa  141  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  28.67 
 
 
1838 aa  135  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  36.45 
 
 
2224 aa  132  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  36.51 
 
 
2124 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  33.77 
 
 
2082 aa  130  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.71 
 
 
2213 aa  127  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.61 
 
 
1764 aa  125  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.42 
 
 
1672 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  26.74 
 
 
1780 aa  125  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.25 
 
 
1754 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.76 
 
 
1698 aa  121  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.85 
 
 
2136 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  31.18 
 
 
2125 aa  119  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
2099 aa  119  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.12 
 
 
2113 aa  118  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.12 
 
 
2113 aa  118  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  34.12 
 
 
2113 aa  118  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.71 
 
 
1711 aa  117  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  32.33 
 
 
2087 aa  117  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.12 
 
 
2113 aa  116  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.35 
 
 
1861 aa  116  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.25 
 
 
1695 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 
1743 aa  114  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.06 
 
 
1711 aa  112  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.19 
 
 
1770 aa  110  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
1725 aa  109  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.65 
 
 
1734 aa  109  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 
1704 aa  106  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  46.09 
 
 
2097 aa  105  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.04 
 
 
1722 aa  105  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
1719 aa  104  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.06 
 
 
1765 aa  103  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.2 
 
 
1723 aa  103  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
1741 aa  102  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.75 
 
 
1723 aa  98.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
744 aa  90.9  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
744 aa  87.8  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  28.07 
 
 
905 aa  84  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
744 aa  83.6  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.46 
 
 
739 aa  80.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
744 aa  78.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  27.95 
 
 
797 aa  78.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.27 
 
 
941 aa  77.4  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 
751 aa  77  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
768 aa  76.3  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  27.62 
 
 
815 aa  75.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
740 aa  75.5  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  33.12 
 
 
321 aa  74.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.49 
 
 
1948 aa  74.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.84 
 
 
756 aa  73.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  29.35 
 
 
758 aa  73.2  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 
807 aa  72  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.57 
 
 
716 aa  71.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.4 
 
 
763 aa  70.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.03 
 
 
972 aa  70.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.81 
 
 
759 aa  69.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  28.24 
 
 
912 aa  68.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.35 
 
 
736 aa  68.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
815 aa  68.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
762 aa  68.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
751 aa  67.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.88 
 
 
790 aa  67  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  26.53 
 
 
746 aa  67  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0592  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.94 
 
 
1458 aa  66.6  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
808 aa  66.6  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
959 aa  66.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.09 
 
 
1198 aa  65.9  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
739 aa  65.9  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.83 
 
 
710 aa  65.9  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
932 aa  65.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.92 
 
 
706 aa  65.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
1053 aa  65.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.6 
 
 
701 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.39 
 
 
764 aa  64.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.52 
 
 
685 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>