More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4091 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  33.06 
 
 
2106 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41 
 
 
2104 aa  989    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1422 aa  2957    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  32.33 
 
 
2104 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.2 
 
 
2104 aa  619  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
2104 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.35 
 
 
2120 aa  563  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3653  hypothetical protein  42.32 
 
 
906 aa  330  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  40.98 
 
 
459 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  26.59 
 
 
2093 aa  195  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.81 
 
 
1787 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.31 
 
 
1542 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.36 
 
 
1607 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.29 
 
 
1561 aa  164  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.11 
 
 
1740 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.65 
 
 
1741 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  25.18 
 
 
1784 aa  155  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.42 
 
 
1525 aa  153  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.48 
 
 
1602 aa  148  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  23.43 
 
 
1578 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.91 
 
 
1589 aa  147  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.66 
 
 
1543 aa  140  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.66 
 
 
1543 aa  140  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.12 
 
 
1698 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.37 
 
 
1722 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.62 
 
 
1759 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  26.47 
 
 
2097 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.77 
 
 
2113 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.25 
 
 
1780 aa  111  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.28 
 
 
2113 aa  110  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  22.28 
 
 
2113 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.28 
 
 
2113 aa  109  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.8 
 
 
2099 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.11 
 
 
1711 aa  108  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.79 
 
 
1741 aa  108  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.36 
 
 
1743 aa  108  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.38 
 
 
1764 aa  107  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.98 
 
 
1734 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.34 
 
 
1723 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.59 
 
 
1770 aa  100  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.06 
 
 
2136 aa  99.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
1711 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  24.96 
 
 
1878 aa  96.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.03 
 
 
1672 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  26.03 
 
 
1704 aa  94.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 
1695 aa  92.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.36 
 
 
1861 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.1 
 
 
1765 aa  88.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.89 
 
 
1948 aa  87  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.81 
 
 
1725 aa  86.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.45 
 
 
1754 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
1719 aa  82  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.46 
 
 
1723 aa  80.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  23.84 
 
 
1838 aa  78.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  22.94 
 
 
2082 aa  77  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 
751 aa  75.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  22.27 
 
 
2087 aa  71.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 
739 aa  70.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.21 
 
 
2213 aa  68.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
744 aa  68.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.24 
 
 
744 aa  68.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.42 
 
 
744 aa  66.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.23 
 
 
756 aa  64.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
740 aa  63.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  24.38 
 
 
2125 aa  62.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 
868 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.53 
 
 
698 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  37.35 
 
 
943 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 
768 aa  58.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 
764 aa  58.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  44.29 
 
 
2124 aa  58.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
815 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.5 
 
 
744 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.84 
 
 
803 aa  58.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
778 aa  58.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
900 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.37 
 
 
716 aa  57.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  30.5 
 
 
939 aa  57.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
503 aa  57.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  27.27 
 
 
865 aa  56.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  39.68 
 
 
1668 aa  57  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
812 aa  57  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.1 
 
 
555 aa  56.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  29.01 
 
 
795 aa  56.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  28.67 
 
 
690 aa  55.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
766 aa  56.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
448 aa  55.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
781 aa  55.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 
706 aa  55.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  30.77 
 
 
804 aa  55.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.16 
 
 
681 aa  55.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  22.14 
 
 
2224 aa  55.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
931 aa  55.5  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48 
 
 
903 aa  55.5  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
738 aa  55.5  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.62 
 
 
696 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 
722 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
546 aa  54.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  40.3 
 
 
954 aa  54.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  86.21 
 
 
128 aa  55.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>