More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1418 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.15 
 
 
2113 aa  1437    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.65 
 
 
2113 aa  1423    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  39.06 
 
 
2113 aa  1430    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
2136 aa  4410    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.06 
 
 
2113 aa  1432    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  31.57 
 
 
2082 aa  793    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.91 
 
 
2099 aa  1781    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 
2213 aa  849    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  30.51 
 
 
2087 aa  774    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  29.73 
 
 
2224 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  29.26 
 
 
2125 aa  600  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  27.39 
 
 
2124 aa  443  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 
1602 aa  182  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.22 
 
 
1607 aa  179  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 
1542 aa  165  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  29.57 
 
 
2093 aa  160  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  31.25 
 
 
1578 aa  159  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
1589 aa  155  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.45 
 
 
1764 aa  155  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.82 
 
 
1543 aa  153  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
1543 aa  153  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.92 
 
 
1525 aa  152  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.78 
 
 
1561 aa  150  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
1770 aa  143  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
1861 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 
1743 aa  137  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
2120 aa  136  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.39 
 
 
1787 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  34.46 
 
 
2106 aa  134  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  38.56 
 
 
1838 aa  133  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.62 
 
 
1765 aa  132  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.07 
 
 
1722 aa  132  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 
1759 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.95 
 
 
1711 aa  130  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.55 
 
 
1723 aa  130  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.07 
 
 
1672 aa  130  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.09 
 
 
1698 aa  129  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.24 
 
 
1734 aa  128  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
1723 aa  125  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
1711 aa  125  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.74 
 
 
1725 aa  124  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  30.79 
 
 
1784 aa  124  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 
1719 aa  123  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  31.27 
 
 
1704 aa  123  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  32.1 
 
 
2104 aa  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.1 
 
 
2104 aa  121  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.19 
 
 
1754 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
1695 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.85 
 
 
2104 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
1741 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
685 aa  117  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  24.13 
 
 
2097 aa  111  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
2104 aa  110  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  21.06 
 
 
1422 aa  99.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  35.11 
 
 
905 aa  98.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
815 aa  92  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.09 
 
 
1053 aa  86.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.11 
 
 
1740 aa  85.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 
1741 aa  84.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.85 
 
 
972 aa  82.8  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.56 
 
 
1198 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  30.92 
 
 
986 aa  79  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  32.43 
 
 
797 aa  77.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  31.9 
 
 
1780 aa  78.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
744 aa  77.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 
959 aa  76.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
744 aa  76.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.3 
 
 
1086 aa  76.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.57 
 
 
739 aa  75.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
962 aa  75.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
756 aa  75.1  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  25.61 
 
 
1878 aa  74.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.08 
 
 
758 aa  74.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.35 
 
 
808 aa  74.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
738 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
762 aa  73.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  30.41 
 
 
740 aa  73.6  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.66 
 
 
803 aa  73.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  35.34 
 
 
459 aa  73.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.36 
 
 
751 aa  72.4  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.29 
 
 
806 aa  72.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 
740 aa  72  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.26 
 
 
807 aa  72  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.38 
 
 
736 aa  70.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
321 aa  70.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.35 
 
 
744 aa  70.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  26.88 
 
 
815 aa  70.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.02 
 
 
752 aa  70.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
909 aa  70.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  28.23 
 
 
931 aa  70.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.62 
 
 
1178 aa  70.1  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.92 
 
 
751 aa  69.7  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  29.55 
 
 
1210 aa  69.7  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
926 aa  69.3  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 
763 aa  69.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  32.16 
 
 
736 aa  69.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.64 
 
 
855 aa  68.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
744 aa  68.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  30.46 
 
 
740 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 
916 aa  68.6  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>