More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1675 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3653  hypothetical protein  64.81 
 
 
906 aa  893    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
2104 aa  4390    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  35.55 
 
 
2106 aa  1192    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  32.83 
 
 
2104 aa  932    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.85 
 
 
2104 aa  936    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
2104 aa  929    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
2120 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  41 
 
 
1422 aa  1006    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.39 
 
 
685 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  41.35 
 
 
459 aa  312  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.6 
 
 
1607 aa  278  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  26.02 
 
 
2097 aa  180  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.6 
 
 
1741 aa  174  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.1 
 
 
1525 aa  174  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.04 
 
 
2093 aa  169  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.31 
 
 
1740 aa  169  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.86 
 
 
1561 aa  168  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.14 
 
 
1589 aa  164  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  27.58 
 
 
1578 aa  164  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.03 
 
 
1787 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
1542 aa  156  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.66 
 
 
1602 aa  152  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  25.3 
 
 
1784 aa  148  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.53 
 
 
1543 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.53 
 
 
1543 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.31 
 
 
1861 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  28.44 
 
 
1838 aa  132  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
1759 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.74 
 
 
1764 aa  131  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.34 
 
 
2082 aa  129  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.14 
 
 
1698 aa  120  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  31.12 
 
 
2087 aa  120  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  24.46 
 
 
1878 aa  119  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 
1722 aa  119  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
2213 aa  119  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.9 
 
 
1723 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.92 
 
 
1743 aa  118  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
1754 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  37.84 
 
 
2224 aa  116  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
2099 aa  116  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.71 
 
 
1734 aa  115  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  29.43 
 
 
2124 aa  114  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  25.27 
 
 
1780 aa  112  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 
1711 aa  112  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
1695 aa  112  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
2136 aa  110  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.04 
 
 
1672 aa  110  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.48 
 
 
1711 aa  108  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.49 
 
 
2113 aa  108  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  33.49 
 
 
2113 aa  108  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.29 
 
 
1770 aa  108  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 
2113 aa  108  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  32.63 
 
 
1704 aa  106  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
2113 aa  107  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 
1725 aa  102  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.46 
 
 
1741 aa  101  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  36.27 
 
 
2125 aa  100  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.76 
 
 
1765 aa  100  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1719 aa  100  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.7 
 
 
1723 aa  98.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.1 
 
 
1948 aa  90.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.04 
 
 
744 aa  89.7  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.79 
 
 
751 aa  87.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.17 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.36 
 
 
758 aa  82.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.83 
 
 
752 aa  82  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
808 aa  81.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 
1053 aa  80.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 
925 aa  79.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
773 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.54 
 
 
764 aa  79  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.81 
 
 
941 aa  78.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 
986 aa  77.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  32.28 
 
 
925 aa  77.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
815 aa  77  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.16 
 
 
764 aa  77  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.98 
 
 
972 aa  76.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  26.94 
 
 
815 aa  75.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.39 
 
 
805 aa  74.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.32 
 
 
685 aa  73.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.36 
 
 
1198 aa  73.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
751 aa  73.6  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
762 aa  73.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  29.13 
 
 
758 aa  72.8  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 
962 aa  72.4  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.66 
 
 
739 aa  71.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
701 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
768 aa  72  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  26.89 
 
 
831 aa  72  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.03 
 
 
937 aa  71.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.76 
 
 
736 aa  71.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 
706 aa  71.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
927 aa  70.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.54 
 
 
744 aa  70.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.09 
 
 
815 aa  70.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.42 
 
 
829 aa  69.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 
744 aa  69.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
959 aa  69.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  27.06 
 
 
905 aa  69.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.53 
 
 
1086 aa  69.3  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>