239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0631 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  92.53 
 
 
1741 aa  3369    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1740 aa  3613    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 
1759 aa  939    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.92 
 
 
1787 aa  810    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  26.92 
 
 
1784 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.02 
 
 
1578 aa  238  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  37.56 
 
 
2097 aa  228  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  26.76 
 
 
1878 aa  197  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.9 
 
 
1780 aa  192  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.28 
 
 
1948 aa  183  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.38 
 
 
1607 aa  179  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.26 
 
 
2104 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.26 
 
 
2104 aa  176  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  23.13 
 
 
2104 aa  174  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.57 
 
 
1602 aa  167  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.95 
 
 
1525 aa  166  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  25.11 
 
 
1422 aa  160  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  26.67 
 
 
2093 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.97 
 
 
1561 aa  154  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.16 
 
 
1543 aa  154  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.16 
 
 
1543 aa  154  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.51 
 
 
1542 aa  153  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.31 
 
 
2104 aa  152  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.47 
 
 
2120 aa  148  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.24 
 
 
1589 aa  143  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  24.31 
 
 
2106 aa  134  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.71 
 
 
1764 aa  126  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
2213 aa  123  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.56 
 
 
1698 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.01 
 
 
685 aa  117  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  23.24 
 
 
1838 aa  111  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.62 
 
 
1861 aa  109  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 
1741 aa  101  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.88 
 
 
1725 aa  100  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.1 
 
 
1723 aa  100  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.73 
 
 
1734 aa  98.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  25.65 
 
 
459 aa  96.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.1 
 
 
1719 aa  96.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 
1723 aa  96.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38 
 
 
1722 aa  92.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1743 aa  90.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  21.19 
 
 
2082 aa  90.5  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
1754 aa  89.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
1770 aa  89.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
1711 aa  89.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
1765 aa  87.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.35 
 
 
1695 aa  87.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.89 
 
 
1711 aa  87  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  21.01 
 
 
2087 aa  86.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.64 
 
 
2099 aa  86.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.11 
 
 
2136 aa  85.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
2113 aa  84  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  34.04 
 
 
1704 aa  82.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  38.46 
 
 
2113 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.46 
 
 
2113 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 
2113 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.62 
 
 
1672 aa  76.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  30.06 
 
 
2224 aa  67.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  24.61 
 
 
1528 aa  67.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.6 
 
 
756 aa  67.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 
739 aa  63.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.75 
 
 
744 aa  62.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  29.24 
 
 
2125 aa  62.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  30.28 
 
 
2124 aa  62.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.35 
 
 
751 aa  61.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.99 
 
 
768 aa  58.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
744 aa  58.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
740 aa  57.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.04 
 
 
1489 aa  57.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
744 aa  57.4  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 
773 aa  57.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.92 
 
 
758 aa  57.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  32.41 
 
 
1321 aa  56.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  33.02 
 
 
436 aa  56.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  31 
 
 
866 aa  56.2  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
764 aa  55.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.38 
 
 
752 aa  55.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 
762 aa  55.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  30.77 
 
 
797 aa  53.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  39.77 
 
 
912 aa  53.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.68 
 
 
808 aa  53.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
759 aa  53.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.37 
 
 
897 aa  53.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.13 
 
 
634 aa  52.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  33 
 
 
891 aa  53.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.89 
 
 
937 aa  52.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.9 
 
 
812 aa  52.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  32.18 
 
 
906 aa  52.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  32.97 
 
 
780 aa  52.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.29 
 
 
751 aa  52.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  32.38 
 
 
986 aa  52.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.16 
 
 
941 aa  52.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.21 
 
 
753 aa  52  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  34.68 
 
 
1668 aa  52  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  27.22 
 
 
1475 aa  51.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.08 
 
 
632 aa  51.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1437  DEAD/DEAH box helicase-like  34.78 
 
 
446 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.45 
 
 
807 aa  50.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.44 
 
 
928 aa  51.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  28.92 
 
 
758 aa  51.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>