191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2941 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 
1475 aa  3043    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.55 
 
 
1489 aa  635  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  35.12 
 
 
1528 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
2213 aa  74.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  25.75 
 
 
1506 aa  72.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.54 
 
 
2099 aa  72  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  24.67 
 
 
1493 aa  72  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.43 
 
 
1538 aa  65.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.65 
 
 
1538 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.43 
 
 
1538 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  25.65 
 
 
1538 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  25.65 
 
 
1538 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 
2136 aa  64.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.65 
 
 
1525 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  25.65 
 
 
1538 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.65 
 
 
1538 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 
694 aa  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  26.27 
 
 
2113 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.27 
 
 
2113 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
2113 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
1539 aa  61.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.16 
 
 
1561 aa  61.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.07 
 
 
2113 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.96 
 
 
1764 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  26.05 
 
 
2093 aa  60.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.05 
 
 
1516 aa  60.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  25.3 
 
 
1178 aa  60.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  24.73 
 
 
1513 aa  60.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  24.31 
 
 
1604 aa  59.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  25.39 
 
 
1509 aa  59.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.62 
 
 
1770 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  23.52 
 
 
1618 aa  59.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  27.25 
 
 
1668 aa  58.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.16 
 
 
751 aa  58.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  23.71 
 
 
1784 aa  58.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.6 
 
 
931 aa  58.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  24 
 
 
1838 aa  58.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  24.17 
 
 
915 aa  57.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.23 
 
 
756 aa  57.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.82 
 
 
815 aa  57.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  24.4 
 
 
1535 aa  57  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  24.2 
 
 
1584 aa  57  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.01 
 
 
1497 aa  56.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.9 
 
 
1741 aa  55.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.83 
 
 
805 aa  55.5  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  24.63 
 
 
1567 aa  55.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  24.52 
 
 
1544 aa  55.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  25.28 
 
 
2087 aa  55.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  23.71 
 
 
1431 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.19 
 
 
2120 aa  54.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.17 
 
 
820 aa  54.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  22.84 
 
 
1510 aa  53.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.49 
 
 
1725 aa  53.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.16 
 
 
927 aa  53.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.28 
 
 
739 aa  53.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  25.35 
 
 
2106 aa  53.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  24.26 
 
 
1729 aa  53.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  22.49 
 
 
1534 aa  53.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.73 
 
 
1607 aa  53.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.66 
 
 
1787 aa  53.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.14 
 
 
1722 aa  52.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.92 
 
 
741 aa  52.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  26.46 
 
 
1549 aa  52.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.89 
 
 
752 aa  52.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.56 
 
 
1589 aa  52.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.11 
 
 
1543 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.11 
 
 
1543 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.44 
 
 
1451 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.98 
 
 
1525 aa  52.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.87 
 
 
1602 aa  52.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.27 
 
 
803 aa  52  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.71 
 
 
1578 aa  52  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.79 
 
 
819 aa  51.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  24.89 
 
 
2224 aa  51.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.29 
 
 
1542 aa  51.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.17 
 
 
914 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.84 
 
 
1948 aa  50.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.22 
 
 
1740 aa  51.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  22.47 
 
 
795 aa  50.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.95 
 
 
972 aa  50.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.22 
 
 
1561 aa  50.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.47 
 
 
1429 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.39 
 
 
701 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.29 
 
 
828 aa  50.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  21.4 
 
 
941 aa  50.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.58 
 
 
928 aa  50.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  24.23 
 
 
2104 aa  49.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  28 
 
 
1649 aa  49.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.23 
 
 
2104 aa  49.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  21.92 
 
 
1448 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  22.16 
 
 
865 aa  49.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.84 
 
 
608 aa  49.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.62 
 
 
2104 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
729 aa  49.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.01 
 
 
607 aa  48.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
1759 aa  48.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  21.97 
 
 
828 aa  48.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87539  pre-mRNA processing RNA-helicase  25.79 
 
 
875 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.223181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  22.22 
 
 
872 aa  48.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.07 
 
 
607 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>