163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2637 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  30.5 
 
 		 1475 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  100 
 
 		 1528 aa  3051    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.31 
 
 		 1489 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 		 1764 aa  73.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.09 
 
 		 2113 aa  68.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.61 
 
 		 1740 aa  68.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.78 
 
 		 2113 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  25.78 
 
 		 2113 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 2113 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.82 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.8 
 
 		 2136 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 1561 aa  62.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  25.6 
 
 		 1784 aa  62.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 2213 aa  62  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.14 
 
 		 1787 aa  61.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.09 
 
 		 1741 aa  61.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  28.44 
 
 		 1509 aa  59.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.6 
 
 		 756 aa  58.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.48 
 
 		 1759 aa  58.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.46 
 
 		 694 aa  57.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  22.22 
 
 		 1578 aa  57  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 1539 aa  55.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  30.66 
 
 		 986 aa  55.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1838 aa  55.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.12 
 
 		 711 aa  55.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  23.84 
 
 		 906 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 736 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.15 
 
 		 1567 aa  54.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.91 
 
 		 1602 aa  53.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 737 aa  53.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.52 
 
 		 734 aa  53.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  27.76 
 
 		 1618 aa  53.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 725 aa  52.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 725 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 2099 aa  52.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  28.65 
 
 		 1549 aa  52.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.5 
 
 		 615 aa  52  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  25.73 
 
 		 1584 aa  52  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 1514 aa  51.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.77 
 
 		 905 aa  51.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.67 
 
 		 911 aa  51.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 729 aa  51.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1534 aa  50.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 734 aa  51.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  36.92 
 
 		 1601 aa  50.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 731 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  23.42 
 
 		 1480 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.05 
 
 		 972 aa  50.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 744 aa  50.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 729 aa  50.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 1516 aa  50.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.67 
 
 		 602 aa  50.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  39.29 
 
 		 724 aa  50.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 594 aa  50.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  24.37 
 
 		 736 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 		 592 aa  49.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  25.66 
 
 		 1448 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  44.64 
 
 		 613 aa  49.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.54 
 
 		 1743 aa  49.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 		 744 aa  49.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 606 aa  49.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.03 
 
 		 718 aa  48.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  33.33 
 
 		 943 aa  48.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 815 aa  48.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 916 aa  48.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 612 aa  48.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 626 aa  48.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.18 
 
 		 697 aa  48.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  24.24 
 
 		 872 aa  48.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.8 
 
 		 738 aa  47.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  27.48 
 
 		 1493 aa  48.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 733 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.46 
 
 		 1607 aa  48.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.09 
 
 		 1589 aa  48.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 		 698 aa  48.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.43 
 
 		 764 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 		 556 aa  47.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  25.88 
 
 		 743 aa  47.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3541  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 		 644 aa  47.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 		 972 aa  47.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  39.58 
 
 		 1741 aa  47.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 		 709 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  39.29 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 		 740 aa  47.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.24 
 
 		 914 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  32.98 
 
 		 1287 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.64 
 
 		 698 aa  47.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.36 
 
 		 890 aa  47.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 		 709 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  37.76 
 
 		 1538 aa  46.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.63 
 
 		 716 aa  47  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 		 607 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 607 aa  46.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.22 
 
 		 1525 aa  47  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 		 607 aa  47  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  37.76 
 
 		 1538 aa  46.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40 
 
 		 697 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.11 
 
 		 709 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.69 
 
 		 931 aa  46.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  37.76 
 
 		 1538 aa  46.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>