147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2279 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 548 aa  1115    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.43 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2225  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 461 aa  158  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00595472  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  29.87 
 
 		 484 aa  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  27.93 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.95 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  26.79 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 799 aa  97.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  26.68 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.93 
 
 		 850 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  24.57 
 
 		 566 aa  88.2  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 780 aa  87.4  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.32 
 
 		 762 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  23.58 
 
 		 873 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  37.5 
 
 		 737 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 750 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  32.94 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  27.47 
 
 		 843 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  25.84 
 
 		 828 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  25.18 
 
 		 912 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.47 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 899 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  27.75 
 
 		 721 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  27.01 
 
 		 912 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  35.58 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 		 859 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.82 
 
 		 967 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  35.96 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  23.69 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  24.38 
 
 		 885 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  30.67 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.01 
 
 		 948 aa  64.3  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.27 
 
 		 920 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.85 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.4 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  33.86 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  22.74 
 
 		 832 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  33.06 
 
 		 800 aa  62  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  24.06 
 
 		 892 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 744 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  26.06 
 
 		 887 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  35.92 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  22.64 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  26.06 
 
 		 887 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  28.79 
 
 		 1209 aa  60.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 		 914 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  30.36 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.34 
 
 		 917 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  22.51 
 
 		 944 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  36.04 
 
 		 854 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.48 
 
 		 795 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  30.36 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  23.18 
 
 		 801 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  24.06 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.63 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  35.58 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  29.55 
 
 		 908 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  32.12 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  24.39 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  23.32 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  29.46 
 
 		 888 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.9 
 
 		 811 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  29.03 
 
 		 764 aa  57  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  31.73 
 
 		 775 aa  57  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  38.61 
 
 		 854 aa  57  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  26.59 
 
 		 901 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  33.88 
 
 		 778 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  26.55 
 
 		 821 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  24.91 
 
 		 922 aa  56.6  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  32.85 
 
 		 729 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  22.98 
 
 		 731 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 1027 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  35.85 
 
 		 907 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 905 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 887 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  20.64 
 
 		 883 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  23.81 
 
 		 860 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  30.97 
 
 		 933 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.84 
 
 		 820 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.71 
 
 		 732 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  24.05 
 
 		 904 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.65 
 
 		 929 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  34.23 
 
 		 778 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  23.81 
 
 		 594 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.48 
 
 		 827 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.56 
 
 		 885 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.81 
 
 		 962 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 		 971 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.44 
 
 		 837 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  28.67 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  27.82 
 
 		 765 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  21.88 
 
 		 860 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.09 
 
 		 724 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>