More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1390 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.85 
 
 		 810 aa  1409    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.42 
 
 		 811 aa  1588    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.42 
 
 		 811 aa  1594    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 811 aa  1645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.5 
 
 		 816 aa  1062    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  34.95 
 
 		 825 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.35 
 
 		 825 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 		 820 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.31 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.43 
 
 		 727 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.54 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.54 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.94 
 
 		 699 aa  389  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.79 
 
 		 669 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.17 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  39.66 
 
 		 903 aa  365  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.12 
 
 		 695 aa  362  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  36.7 
 
 		 701 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 		 715 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 756 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  29.6 
 
 		 726 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 		 706 aa  168  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  32.6 
 
 		 723 aa  167  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  27.43 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  31.31 
 
 		 760 aa  161  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  28.81 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  25.65 
 
 		 729 aa  159  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 707 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30.25 
 
 		 824 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 707 aa  157  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 747 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.75 
 
 		 747 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.83 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.34 
 
 		 707 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.84 
 
 		 746 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  29.89 
 
 		 693 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.34 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 751 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 708 aa  146  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.93 
 
 		 799 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.35 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.87 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  28.63 
 
 		 808 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 1265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.96 
 
 		 700 aa  134  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.37 
 
 		 694 aa  123  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.87 
 
 		 988 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.09 
 
 		 807 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.41 
 
 		 657 aa  120  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.09 
 
 		 800 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 		 739 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.36 
 
 		 780 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.9 
 
 		 889 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.29 
 
 		 874 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.11 
 
 		 803 aa  108  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.8 
 
 		 785 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1230 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.52 
 
 		 1318 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.64 
 
 		 898 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.68 
 
 		 893 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.03 
 
 		 2015 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  27.83 
 
 		 908 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.82 
 
 		 1465 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  24.55 
 
 		 2189 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 		 897 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.38 
 
 		 909 aa  99  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.42 
 
 		 928 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  25.89 
 
 		 2208 aa  98.2  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.99 
 
 		 1004 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 903 aa  97.4  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  23.12 
 
 		 402 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  26.73 
 
 		 924 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.33 
 
 		 927 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.87 
 
 		 708 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.33 
 
 		 927 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 928 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 		 932 aa  95.1  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 927 aa  94.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27 
 
 		 937 aa  94.4  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  22.86 
 
 		 2152 aa  94  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.86 
 
 		 716 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.37 
 
 		 845 aa  91.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 1942 aa  90.9  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  24.11 
 
 		 2111 aa  90.5  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.37 
 
 		 1060 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.45 
 
 		 762 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.68 
 
 		 1767 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.53 
 
 		 926 aa  88.6  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.1 
 
 		 916 aa  87.8  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.12 
 
 		 710 aa  87.4  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.25 
 
 		 946 aa  86.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  30.65 
 
 		 1026 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.25 
 
 		 1004 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  24.17 
 
 		 1710 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.86 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  25.26 
 
 		 872 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.44 
 
 		 2157 aa  82.4  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.11 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>