More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1673 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.23 
 
 
780 aa  1105    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
785 aa  1575    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  85.04 
 
 
803 aa  1372    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.03 
 
 
807 aa  1131    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.93 
 
 
800 aa  1090    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  31.71 
 
 
1770 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  32.75 
 
 
2015 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  32.47 
 
 
1060 aa  272  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  31.95 
 
 
2208 aa  270  8.999999999999999e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  33.16 
 
 
2189 aa  270  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  33.73 
 
 
1767 aa  270  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  31.37 
 
 
1942 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  32.57 
 
 
2152 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  31.39 
 
 
2111 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  32.84 
 
 
1589 aa  263  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  34.13 
 
 
2157 aa  261  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  33.38 
 
 
729 aa  258  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.02 
 
 
791 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.87 
 
 
799 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  31.95 
 
 
760 aa  248  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  32.05 
 
 
712 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  33.51 
 
 
1465 aa  235  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.4 
 
 
723 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  36.48 
 
 
824 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
706 aa  228  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
756 aa  228  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
708 aa  226  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  35.21 
 
 
808 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  35.31 
 
 
799 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  30.37 
 
 
726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.34 
 
 
694 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  33.2 
 
 
693 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.5 
 
 
709 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  31.18 
 
 
1385 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 
710 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
729 aa  213  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.73 
 
 
662 aa  208  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  30.67 
 
 
1710 aa  207  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 
747 aa  207  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 
747 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
746 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.64 
 
 
707 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.78 
 
 
739 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
707 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 
700 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
707 aa  195  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.56 
 
 
727 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.64 
 
 
715 aa  194  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.06 
 
 
751 aa  194  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.66 
 
 
1230 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.51 
 
 
1318 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  28.46 
 
 
874 aa  157  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.48 
 
 
1055 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.4 
 
 
927 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.16 
 
 
927 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  31.04 
 
 
926 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.81 
 
 
872 aa  149  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  30.68 
 
 
924 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.31 
 
 
924 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.57 
 
 
919 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 
1265 aa  144  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.98 
 
 
889 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  30.36 
 
 
924 aa  144  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 
988 aa  138  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.75 
 
 
908 aa  137  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.57 
 
 
905 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 
1166 aa  134  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  28.01 
 
 
908 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.34 
 
 
893 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.76 
 
 
908 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  28.57 
 
 
908 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.43 
 
 
762 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  31.32 
 
 
906 aa  128  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
815 aa  126  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
843 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 
952 aa  125  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.8 
 
 
996 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  30.44 
 
 
1165 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.79 
 
 
845 aa  121  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 
919 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.67 
 
 
998 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 
1197 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 
1068 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 
1173 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  31.34 
 
 
825 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
820 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  25.41 
 
 
901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  28.1 
 
 
890 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.12 
 
 
825 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.6 
 
 
708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  28.11 
 
 
882 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.3 
 
 
811 aa  111  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  30.83 
 
 
1173 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.19 
 
 
1004 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
811 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.13 
 
 
727 aa  107  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 
709 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.97 
 
 
688 aa  103  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.77 
 
 
810 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>