More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05090 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  57.19 
 
 		 1073 aa  1132    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  49.8 
 
 		 998 aa  929    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1068 aa  2207    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  48.4 
 
 		 933 aa  906    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  44.66 
 
 		 1023 aa  837    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  60.08 
 
 		 1068 aa  1238    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  37.28 
 
 		 872 aa  569  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  35.01 
 
 		 1239 aa  554  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  35.14 
 
 		 1175 aa  551  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  45.64 
 
 		 1185 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  31.41 
 
 		 906 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  30.95 
 
 		 936 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30.44 
 
 		 904 aa  366  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 		 933 aa  362  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  29.86 
 
 		 918 aa  358  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.96 
 
 		 996 aa  349  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  29.37 
 
 		 916 aa  337  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.18 
 
 		 951 aa  325  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.83 
 
 		 950 aa  324  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.99 
 
 		 917 aa  324  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.49 
 
 		 919 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.68 
 
 		 950 aa  323  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  34.69 
 
 		 972 aa  323  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  34.72 
 
 		 909 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.05 
 
 		 952 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.05 
 
 		 931 aa  320  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.08 
 
 		 918 aa  319  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.08 
 
 		 918 aa  319  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.65 
 
 		 981 aa  318  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 		 929 aa  318  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.64 
 
 		 951 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.08 
 
 		 918 aa  318  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  32.96 
 
 		 1293 aa  317  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  37.71 
 
 		 919 aa  316  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.1 
 
 		 889 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 		 984 aa  315  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  34.87 
 
 		 924 aa  314  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  36.5 
 
 		 893 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  36.67 
 
 		 952 aa  311  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  36.72 
 
 		 927 aa  310  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  38.44 
 
 		 926 aa  310  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.02 
 
 		 964 aa  310  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  33.08 
 
 		 994 aa  310  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.51 
 
 		 927 aa  309  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.87 
 
 		 890 aa  308  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  27.52 
 
 		 953 aa  308  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  38.68 
 
 		 908 aa  306  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  36.02 
 
 		 905 aa  305  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  36.07 
 
 		 906 aa  304  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  35.96 
 
 		 924 aa  304  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  33.1 
 
 		 877 aa  303  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  38.68 
 
 		 908 aa  303  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 		 921 aa  302  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  38.25 
 
 		 908 aa  301  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  34.83 
 
 		 1055 aa  300  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.8 
 
 		 932 aa  297  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  36.95 
 
 		 924 aa  296  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  35.49 
 
 		 863 aa  290  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.2 
 
 		 815 aa  290  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  38.82 
 
 		 908 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  35.31 
 
 		 940 aa  288  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.38 
 
 		 762 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  27.1 
 
 		 1003 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 843 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 709 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.81 
 
 		 817 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.64 
 
 		 990 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  50.26 
 
 		 1026 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.23 
 
 		 947 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  47.5 
 
 		 961 aa  184  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  35.22 
 
 		 967 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  35.22 
 
 		 967 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.52 
 
 		 845 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.3 
 
 		 827 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.22 
 
 		 837 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.28 
 
 		 424 aa  168  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.96 
 
 		 922 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  34.96 
 
 		 935 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 837 aa  158  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 1231 aa  149  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 		 861 aa  147  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.98 
 
 		 715 aa  145  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  28.16 
 
 		 885 aa  143  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  38.13 
 
 		 1209 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.07 
 
 		 791 aa  141  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 709 aa  140  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 700 aa  139  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  27.45 
 
 		 830 aa  139  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  27.47 
 
 		 760 aa  138  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  27.27 
 
 		 693 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 868 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  26.86 
 
 		 861 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  28.18 
 
 		 855 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 832 aa  135  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.29 
 
 		 851 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.54 
 
 		 727 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  27.23 
 
 		 860 aa  131  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 706 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  34.05 
 
 		 516 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 756 aa  128  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>