More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3440 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  48.65 
 
 
994 aa  792    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.36 
 
 
990 aa  834    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.9 
 
 
919 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.35 
 
 
921 aa  1528    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.09 
 
 
947 aa  894    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  58.41 
 
 
918 aa  991    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  52.39 
 
 
952 aa  818    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  55.59 
 
 
935 aa  912    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  55.27 
 
 
940 aa  875    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  49.74 
 
 
953 aa  823    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  53.51 
 
 
916 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.63 
 
 
933 aa  791    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.65 
 
 
996 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  54.66 
 
 
904 aa  905    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  79.44 
 
 
918 aa  1440    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  53.91 
 
 
909 aa  879    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  75.38 
 
 
906 aa  1320    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.49 
 
 
964 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.17 
 
 
917 aa  950    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  54.09 
 
 
906 aa  868    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.99 
 
 
961 aa  704    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  53.3 
 
 
936 aa  896    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.1 
 
 
950 aa  871    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  79.44 
 
 
918 aa  1440    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
929 aa  1867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.32 
 
 
984 aa  833    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.16 
 
 
981 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.65 
 
 
950 aa  790    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.48 
 
 
951 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.46 
 
 
922 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.39 
 
 
932 aa  887    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  51.32 
 
 
972 aa  843    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.18 
 
 
931 aa  871    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  79.12 
 
 
918 aa  1435    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.8 
 
 
951 aa  943    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  47.84 
 
 
1026 aa  532  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  48.24 
 
 
877 aa  521  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  50.72 
 
 
863 aa  507  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.27 
 
 
815 aa  434  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.53 
 
 
889 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.61 
 
 
905 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  33.85 
 
 
926 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  34.84 
 
 
924 aa  399  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.5 
 
 
893 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.94 
 
 
908 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.73 
 
 
924 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.33 
 
 
908 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.5 
 
 
908 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.02 
 
 
927 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  33.55 
 
 
924 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.78 
 
 
927 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.32 
 
 
952 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  29.94 
 
 
967 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.15 
 
 
908 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30 
 
 
967 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  34.03 
 
 
919 aa  366  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  42.16 
 
 
890 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.84 
 
 
1055 aa  357  5e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  28.41 
 
 
1003 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.26 
 
 
872 aa  338  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
1068 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  35.11 
 
 
1239 aa  305  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  35.13 
 
 
1073 aa  300  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  34.6 
 
 
933 aa  298  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.93 
 
 
1068 aa  294  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  35.78 
 
 
1175 aa  292  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  36.53 
 
 
998 aa  291  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.32 
 
 
762 aa  271  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
709 aa  270  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
843 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  47.89 
 
 
1185 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.9 
 
 
424 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  33.94 
 
 
1209 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  47.21 
 
 
1293 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.68 
 
 
845 aa  175  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
868 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.43 
 
 
835 aa  174  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  30.56 
 
 
842 aa  157  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  24.69 
 
 
1023 aa  153  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.27 
 
 
723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 
791 aa  135  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.19 
 
 
729 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.07 
 
 
824 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
861 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
861 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.26 
 
 
1004 aa  128  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.76 
 
 
709 aa  126  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
803 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
708 aa  125  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  35.48 
 
 
861 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.69 
 
 
838 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  26.84 
 
 
760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.67 
 
 
707 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.9 
 
 
800 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
729 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  35.5 
 
 
860 aa  121  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.67 
 
 
817 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 
950 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
739 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>