More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1245 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 845 aa  1722    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.36 
 
 		 817 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  37.64 
 
 		 891 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 		 894 aa  248  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  35.81 
 
 		 855 aa  241  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  35.66 
 
 		 842 aa  240  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  33.2 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  33.67 
 
 		 877 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  37.43 
 
 		 842 aa  235  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.89 
 
 		 831 aa  234  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.56 
 
 		 866 aa  233  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 873 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  31.6 
 
 		 860 aa  230  8e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.79 
 
 		 876 aa  227  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  34.73 
 
 		 830 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.79 
 
 		 837 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.82 
 
 		 861 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.98 
 
 		 827 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.02 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.79 
 
 		 838 aa  222  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 		 832 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 		 865 aa  221  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 		 848 aa  220  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 		 853 aa  220  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.18 
 
 		 847 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.92 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 837 aa  219  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 		 835 aa  218  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.56 
 
 		 847 aa  218  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 		 836 aa  217  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.71 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.71 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.71 
 
 		 852 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 		 868 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.53 
 
 		 1231 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  34.62 
 
 		 853 aa  212  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.36 
 
 		 832 aa  212  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.13 
 
 		 870 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  34.03 
 
 		 926 aa  211  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  33.82 
 
 		 924 aa  210  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  34.64 
 
 		 908 aa  210  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.38 
 
 		 861 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  31.83 
 
 		 861 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.1 
 
 		 950 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  34.69 
 
 		 893 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  33.42 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.38 
 
 		 861 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  35.2 
 
 		 890 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.12 
 
 		 851 aa  209  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.8 
 
 		 856 aa  207  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  33.99 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.49 
 
 		 952 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.43 
 
 		 889 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  33.74 
 
 		 908 aa  205  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  33.33 
 
 		 908 aa  204  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  33.26 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  36.69 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  31.84 
 
 		 924 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.99 
 
 		 762 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.6 
 
 		 927 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.37 
 
 		 927 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.67 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  34.77 
 
 		 905 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  33.41 
 
 		 998 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.91 
 
 		 919 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  32.43 
 
 		 904 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  33.93 
 
 		 909 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  30.5 
 
 		 1068 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  32.44 
 
 		 1068 aa  178  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  34.05 
 
 		 906 aa  177  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.68 
 
 		 929 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 		 951 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  32.84 
 
 		 906 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  32.49 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.95 
 
 		 872 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 921 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  31.76 
 
 		 916 aa  168  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 996 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.51 
 
 		 815 aa  164  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 922 aa  162  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.22 
 
 		 918 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 		 918 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 709 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30.4 
 
 		 824 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 		 843 aa  144  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.16 
 
 		 791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 		 700 aa  141  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  31.62 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 		 715 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  30.7 
 
 		 808 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.45 
 
 		 694 aa  132  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.67 
 
 		 990 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.22 
 
 		 1055 aa  130  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  31.22 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 		 964 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.44 
 
 		 984 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  37.67 
 
 		 961 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.44 
 
 		 947 aa  129  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>