More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  100 
 
 		 842 aa  1715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  63.7 
 
 		 869 aa  1035    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.78 
 
 		 847 aa  1150    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  58.23 
 
 		 885 aa  942    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.11 
 
 		 836 aa  1189    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.21 
 
 		 831 aa  1042    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.21 
 
 		 894 aa  991    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.47 
 
 		 876 aa  777    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.37 
 
 		 950 aa  1217    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  53.75 
 
 		 860 aa  861    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  69.77 
 
 		 838 aa  1137    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.96 
 
 		 853 aa  985    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.78 
 
 		 832 aa  1136    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  54.75 
 
 		 842 aa  879    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.96 
 
 		 827 aa  1243    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.58 
 
 		 1231 aa  1210    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  56.11 
 
 		 855 aa  894    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.62 
 
 		 869 aa  892    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  47.37 
 
 		 861 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  70.69 
 
 		 885 aa  1149    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.84 
 
 		 710 aa  889    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.79 
 
 		 832 aa  1076    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.47 
 
 		 873 aa  998    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.63 
 
 		 847 aa  1083    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  65.33 
 
 		 852 aa  1088    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.11 
 
 		 866 aa  1041    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  60.07 
 
 		 877 aa  969    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.76 
 
 		 856 aa  1061    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.43 
 
 		 848 aa  1142    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.31 
 
 		 861 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.32 
 
 		 865 aa  926    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.03 
 
 		 837 aa  1092    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.33 
 
 		 852 aa  1088    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.63 
 
 		 851 aa  1081    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.33 
 
 		 852 aa  1088    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.43 
 
 		 870 aa  1222    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  59.38 
 
 		 891 aa  982    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.75 
 
 		 861 aa  1117    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  68.33 
 
 		 830 aa  1167    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.61 
 
 		 868 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.26 
 
 		 835 aa  1160    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.31 
 
 		 861 aa  707    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.67 
 
 		 837 aa  1185    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  56.46 
 
 		 853 aa  920    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.09 
 
 		 817 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.42 
 
 		 845 aa  238  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.04 
 
 		 893 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.97 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.83 
 
 		 815 aa  207  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  34.54 
 
 		 890 aa  204  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  34.56 
 
 		 905 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.96 
 
 		 908 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  32.82 
 
 		 908 aa  201  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  31.7 
 
 		 908 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  32.32 
 
 		 926 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.35 
 
 		 927 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.13 
 
 		 927 aa  195  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  31.74 
 
 		 924 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  30.66 
 
 		 924 aa  193  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.45 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.26 
 
 		 919 aa  192  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.47 
 
 		 889 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  31.01 
 
 		 924 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  31.12 
 
 		 906 aa  190  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  29.96 
 
 		 1003 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.77 
 
 		 952 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30.29 
 
 		 904 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.21 
 
 		 998 aa  177  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.74 
 
 		 918 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.74 
 
 		 918 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  30.04 
 
 		 935 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.74 
 
 		 918 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  29.02 
 
 		 933 aa  174  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 843 aa  167  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  28.82 
 
 		 918 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  31.25 
 
 		 872 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 709 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  32.3 
 
 		 548 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.03 
 
 		 694 aa  144  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.58 
 
 		 951 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 706 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  31.95 
 
 		 693 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 		 990 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.64 
 
 		 708 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  27.65 
 
 		 824 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  42.62 
 
 		 1026 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.1 
 
 		 791 aa  132  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 710 aa  132  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 709 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.69 
 
 		 760 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.49 
 
 		 919 aa  130  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 		 996 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  40.1 
 
 		 994 aa  129  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 		 984 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.91 
 
 		 723 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.67 
 
 		 964 aa  128  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.13 
 
 		 950 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 756 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.94 
 
 		 799 aa  125  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.38 
 
 		 933 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>