More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3073 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 762 aa  1580    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.75 
 
 		 952 aa  337  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  41.01 
 
 		 926 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  40.62 
 
 		 889 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  40.08 
 
 		 893 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.43 
 
 		 927 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  39.43 
 
 		 927 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  39.82 
 
 		 924 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  38.94 
 
 		 924 aa  323  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  39.56 
 
 		 890 aa  323  9.000000000000001e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  38.66 
 
 		 905 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  39.47 
 
 		 919 aa  316  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  38.33 
 
 		 924 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  38.54 
 
 		 908 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  38.76 
 
 		 908 aa  306  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  38.34 
 
 		 908 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  38.05 
 
 		 908 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  39.29 
 
 		 998 aa  295  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  34.65 
 
 		 904 aa  293  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  36.46 
 
 		 1239 aa  290  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  33.02 
 
 		 933 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 		 1068 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.19 
 
 		 996 aa  285  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  35.01 
 
 		 1055 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  34.85 
 
 		 1023 aa  284  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 		 919 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  35.53 
 
 		 872 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  34.1 
 
 		 1068 aa  282  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.76 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  28.52 
 
 		 877 aa  280  7e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  32.39 
 
 		 906 aa  280  9e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  35.73 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 		 933 aa  278  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.02 
 
 		 815 aa  277  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  35.74 
 
 		 906 aa  277  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.97 
 
 		 950 aa  277  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  34.53 
 
 		 916 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  31.67 
 
 		 918 aa  277  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  34.3 
 
 		 967 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  34.3 
 
 		 967 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  32.95 
 
 		 909 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  33.15 
 
 		 935 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  31.68 
 
 		 936 aa  275  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  36.26 
 
 		 1073 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  33.26 
 
 		 952 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 		 929 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.4 
 
 		 917 aa  270  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 921 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.75 
 
 		 918 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.75 
 
 		 918 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.75 
 
 		 918 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 922 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  32.1 
 
 		 940 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 		 932 aa  264  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  33.21 
 
 		 1003 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 		 931 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  30.38 
 
 		 953 aa  251  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.63 
 
 		 709 aa  247  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.28 
 
 		 843 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.24 
 
 		 861 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.24 
 
 		 861 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  31.88 
 
 		 861 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.68 
 
 		 868 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.34 
 
 		 817 aa  217  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.32 
 
 		 424 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  34.1 
 
 		 853 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.02 
 
 		 710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.99 
 
 		 845 aa  201  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 		 876 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 		 866 aa  195  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.05 
 
 		 861 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  33.33 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.89 
 
 		 847 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  34.38 
 
 		 855 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  31.45 
 
 		 842 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.57 
 
 		 869 aa  190  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.87 
 
 		 873 aa  190  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  30.42 
 
 		 830 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.07 
 
 		 837 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  32.84 
 
 		 885 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.07 
 
 		 832 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  31.09 
 
 		 869 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  49.19 
 
 		 1293 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.38 
 
 		 847 aa  187  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 832 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.71 
 
 		 981 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  45 
 
 		 1185 aa  185  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.63 
 
 		 838 aa  185  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.89 
 
 		 894 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.53 
 
 		 827 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  31.66 
 
 		 885 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.39 
 
 		 853 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.68 
 
 		 837 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.63 
 
 		 852 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 852 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 852 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 950 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.44 
 
 		 835 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  30.21 
 
 		 860 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>