More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3396 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.7 
 
 		 866 aa  936    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  50.92 
 
 		 842 aa  841    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.39 
 
 		 950 aa  1093    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  65.82 
 
 		 830 aa  1135    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.22 
 
 		 861 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.45 
 
 		 894 aa  931    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.46 
 
 		 831 aa  989    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  66.23 
 
 		 838 aa  1104    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.98 
 
 		 876 aa  723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.14 
 
 		 861 aa  1003    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  45.64 
 
 		 861 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  64.58 
 
 		 885 aa  1049    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.5 
 
 		 869 aa  864    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.93 
 
 		 868 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  64.79 
 
 		 842 aa  1093    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.08 
 
 		 873 aa  912    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.55 
 
 		 1231 aa  1100    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.34 
 
 		 861 aa  702    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.28 
 
 		 847 aa  1030    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.83 
 
 		 836 aa  1086    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.58 
 
 		 832 aa  1119    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  62.48 
 
 		 852 aa  1034    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.59 
 
 		 847 aa  1018    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  52.17 
 
 		 860 aa  833    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.31 
 
 		 853 aa  957    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.29 
 
 		 848 aa  1032    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 832 aa  1711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.68 
 
 		 837 aa  1040    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  54.04 
 
 		 877 aa  894    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.5 
 
 		 856 aa  1019    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.26 
 
 		 865 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.48 
 
 		 835 aa  1165    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.48 
 
 		 852 aa  1034    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.41 
 
 		 837 aa  1177    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.57 
 
 		 851 aa  1021    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  54.23 
 
 		 891 aa  920    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.15 
 
 		 827 aa  1093    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.48 
 
 		 870 aa  1116    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  57.77 
 
 		 869 aa  960    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  51.89 
 
 		 855 aa  863    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.88 
 
 		 710 aa  855    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  52.98 
 
 		 885 aa  866    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  53.55 
 
 		 853 aa  861    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.48 
 
 		 852 aa  1033    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.28 
 
 		 817 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.98 
 
 		 845 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.28 
 
 		 1055 aa  204  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  29.55 
 
 		 926 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  28.97 
 
 		 927 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.76 
 
 		 927 aa  200  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  28.45 
 
 		 908 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.02 
 
 		 893 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  30.15 
 
 		 890 aa  196  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.88 
 
 		 905 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  28.52 
 
 		 924 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  29.7 
 
 		 924 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  29.53 
 
 		 935 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 		 762 aa  190  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  31.47 
 
 		 889 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  26.18 
 
 		 872 aa  187  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.09 
 
 		 952 aa  187  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 922 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.38 
 
 		 919 aa  184  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.79 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 929 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  28.91 
 
 		 909 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  25.93 
 
 		 933 aa  178  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  27.43 
 
 		 998 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 843 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  41.45 
 
 		 994 aa  141  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  31.27 
 
 		 548 aa  140  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.02 
 
 		 694 aa  140  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38 
 
 		 950 aa  139  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  37.17 
 
 		 908 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.74 
 
 		 951 aa  137  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  40.88 
 
 		 877 aa  136  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  36.65 
 
 		 908 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.66 
 
 		 964 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 		 919 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.21 
 
 		 984 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  36.65 
 
 		 908 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.32 
 
 		 996 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  39.27 
 
 		 953 aa  134  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  36.54 
 
 		 924 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.8 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  41.76 
 
 		 936 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  38.74 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  41.99 
 
 		 952 aa  131  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  38.66 
 
 		 1026 aa  131  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.34 
 
 		 950 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.24 
 
 		 990 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  38.54 
 
 		 863 aa  127  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.73 
 
 		 951 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  38.54 
 
 		 916 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.81 
 
 		 931 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  38.3 
 
 		 906 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  40.11 
 
 		 961 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  37.91 
 
 		 904 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.32 
 
 		 921 aa  125  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>