More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5818 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.08 
 
 
870 aa  1105    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.39 
 
 
837 aa  1093    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.61 
 
 
852 aa  1439    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.2 
 
 
832 aa  1017    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.47 
 
 
836 aa  1058    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.94 
 
 
873 aa  931    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.75 
 
 
710 aa  863    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  65.02 
 
 
838 aa  1070    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.37 
 
 
831 aa  988    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.48 
 
 
861 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.23 
 
 
866 aa  991    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  87.86 
 
 
837 aa  1464    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.13 
 
 
876 aa  696    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  45.84 
 
 
861 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  64.68 
 
 
885 aa  1053    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60 
 
 
894 aa  961    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.06 
 
 
1231 aa  1082    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.42 
 
 
856 aa  1002    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.22 
 
 
847 aa  1094    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  55.5 
 
 
885 aa  878    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  59.09 
 
 
869 aa  957    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.37 
 
 
835 aa  1103    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.23 
 
 
861 aa  1055    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.58 
 
 
861 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  85.73 
 
 
852 aa  1440    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  65.63 
 
 
842 aa  1100    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.75 
 
 
832 aa  1055    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.4 
 
 
848 aa  1110    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  52.58 
 
 
855 aa  844    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  58.65 
 
 
877 aa  944    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.71 
 
 
865 aa  903    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  51.17 
 
 
860 aa  823    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  54.86 
 
 
853 aa  887    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.02 
 
 
868 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.73 
 
 
852 aa  1440    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
851 aa  1722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.35 
 
 
869 aa  825    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  64.23 
 
 
830 aa  1094    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  51.92 
 
 
842 aa  831    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.07 
 
 
827 aa  1096    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  55.39 
 
 
891 aa  902    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.94 
 
 
950 aa  1097    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  82.82 
 
 
847 aa  1382    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.16 
 
 
853 aa  972    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 
817 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.52 
 
 
845 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.84 
 
 
908 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  31.62 
 
 
926 aa  191  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  31.57 
 
 
1055 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.51 
 
 
908 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.33 
 
 
924 aa  188  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.91 
 
 
889 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  32.81 
 
 
924 aa  187  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.79 
 
 
927 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.03 
 
 
927 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  32.7 
 
 
905 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.88 
 
 
919 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 
952 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  34.03 
 
 
893 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.1 
 
 
890 aa  177  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
843 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.56 
 
 
872 aa  177  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
762 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
919 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  30.88 
 
 
1003 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  28.5 
 
 
933 aa  168  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
815 aa  167  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  32.9 
 
 
548 aa  157  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 
709 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  26.45 
 
 
998 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 
996 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.51 
 
 
694 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.16 
 
 
1068 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
709 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  31.7 
 
 
808 aa  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.45 
 
 
693 aa  126  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
706 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.41 
 
 
723 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  36.84 
 
 
924 aa  124  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.75 
 
 
950 aa  124  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.93 
 
 
922 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  29.97 
 
 
712 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  38.89 
 
 
994 aa  122  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.18 
 
 
747 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  35.18 
 
 
908 aa  122  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.24 
 
 
791 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  36.57 
 
 
1026 aa  121  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  34.5 
 
 
908 aa  121  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 
747 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  38.2 
 
 
909 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.98 
 
 
990 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
951 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  38.29 
 
 
953 aa  119  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  29.72 
 
 
729 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.68 
 
 
707 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.23 
 
 
799 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  37.31 
 
 
906 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
751 aa  118  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
984 aa  118  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  39.38 
 
 
935 aa  118  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>