More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0401 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
694 aa  1408    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  43.02 
 
 
693 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  41.99 
 
 
712 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.28 
 
 
791 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  38.44 
 
 
729 aa  497  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  41.07 
 
 
723 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.85 
 
 
799 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  37.5 
 
 
760 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  39.69 
 
 
726 aa  488  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  40.14 
 
 
799 aa  485  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  37.12 
 
 
808 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.91 
 
 
739 aa  464  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.48 
 
 
756 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
709 aa  451  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  38.99 
 
 
727 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.22 
 
 
746 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.38 
 
 
747 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
747 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.05 
 
 
710 aa  435  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 
706 aa  429  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 
708 aa  430  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.13 
 
 
751 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.3 
 
 
707 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
662 aa  425  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 
707 aa  422  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.73 
 
 
707 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 
715 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.69 
 
 
729 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
700 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  41.78 
 
 
824 aa  391  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.33 
 
 
988 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.84 
 
 
780 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.06 
 
 
1265 aa  241  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.01 
 
 
807 aa  233  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.34 
 
 
785 aa  230  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.01 
 
 
803 aa  226  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.77 
 
 
800 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 
1004 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  34.46 
 
 
2208 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  30.23 
 
 
1060 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  29.22 
 
 
1942 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  27.97 
 
 
1767 aa  173  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  30.77 
 
 
2111 aa  173  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.63 
 
 
1230 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.35 
 
 
1004 aa  173  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  30.05 
 
 
2157 aa  170  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  27.23 
 
 
874 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  27.25 
 
 
2015 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  27.78 
 
 
2189 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  31.16 
 
 
2152 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.67 
 
 
952 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  28.63 
 
 
1465 aa  160  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 
1318 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  27.72 
 
 
1710 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
820 aa  154  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 
847 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.99 
 
 
817 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.97 
 
 
847 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  29.87 
 
 
893 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.53 
 
 
889 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  28.48 
 
 
1055 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.93 
 
 
825 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  31.92 
 
 
890 aa  151  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  31.34 
 
 
825 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  30.61 
 
 
905 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.56 
 
 
852 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
852 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.03 
 
 
827 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
852 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  31.01 
 
 
916 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  28.03 
 
 
1589 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
837 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  30.65 
 
 
830 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.14 
 
 
919 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  30.03 
 
 
842 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
848 aa  144  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 
876 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  28.84 
 
 
936 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  29.26 
 
 
1385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  28.57 
 
 
933 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  28.81 
 
 
906 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
851 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 
868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.36 
 
 
1197 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  28.68 
 
 
904 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 
950 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.32 
 
 
832 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
669 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  29.61 
 
 
1173 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.63 
 
 
838 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  29.2 
 
 
909 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  29.14 
 
 
861 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  29.59 
 
 
1173 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  28.54 
 
 
903 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.97 
 
 
901 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.82 
 
 
873 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.88 
 
 
861 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.76 
 
 
835 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
657 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
837 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>