More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0689 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.45 
 
 
799 aa  983    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  62.75 
 
 
824 aa  997    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  100 
 
 
808 aa  1598    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.73 
 
 
988 aa  744    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.03 
 
 
791 aa  1002    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  44.47 
 
 
729 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  43.68 
 
 
760 aa  592  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  42.45 
 
 
726 aa  569  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  44.77 
 
 
712 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  42.5 
 
 
723 aa  553  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  41.01 
 
 
799 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  41.01 
 
 
693 aa  535  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  41.37 
 
 
727 aa  522  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.83 
 
 
662 aa  488  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.5 
 
 
747 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.12 
 
 
694 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
747 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.5 
 
 
746 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.81 
 
 
707 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
707 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.7 
 
 
756 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.38 
 
 
707 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.23 
 
 
739 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.67 
 
 
751 aa  438  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.96 
 
 
709 aa  432  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.64 
 
 
715 aa  410  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 
700 aa  385  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.82 
 
 
708 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.35 
 
 
706 aa  363  9e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
710 aa  356  1e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.5 
 
 
729 aa  334  3e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.47 
 
 
1265 aa  258  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.21 
 
 
785 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.89 
 
 
800 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 
780 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.06 
 
 
807 aa  234  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.17 
 
 
803 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  28.42 
 
 
874 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  29.74 
 
 
1060 aa  177  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  30.07 
 
 
2189 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.4 
 
 
952 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
1230 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  27.91 
 
 
2152 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  27.95 
 
 
1767 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 
820 aa  158  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  30.99 
 
 
903 aa  158  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  28.85 
 
 
2157 aa  157  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 
1318 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.33 
 
 
901 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.98 
 
 
927 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  26.99 
 
 
825 aa  152  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  30.14 
 
 
927 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  27.6 
 
 
1942 aa  151  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  31.22 
 
 
924 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 
1004 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 
669 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  30.75 
 
 
926 aa  149  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  30.68 
 
 
924 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.22 
 
 
402 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.6 
 
 
1465 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.63 
 
 
2111 aa  148  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.47 
 
 
1055 aa  147  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  26.77 
 
 
1710 aa  147  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.09 
 
 
811 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.68 
 
 
825 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 
811 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 
1004 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
810 aa  144  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.65 
 
 
2015 aa  144  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 
695 aa  144  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.62 
 
 
697 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  27.21 
 
 
2208 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  25.72 
 
 
1770 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  28.47 
 
 
701 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  26.2 
 
 
1589 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.99 
 
 
924 aa  140  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.73 
 
 
817 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.18 
 
 
845 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.95 
 
 
918 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.95 
 
 
918 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.95 
 
 
918 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.67 
 
 
762 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 
667 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.48 
 
 
688 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.21 
 
 
727 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.92 
 
 
831 aa  135  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  28.31 
 
 
918 aa  134  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 
699 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.65 
 
 
894 aa  134  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.03 
 
 
905 aa  134  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 
851 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  29.22 
 
 
889 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.2 
 
 
811 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.62 
 
 
816 aa  132  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  27.05 
 
 
906 aa  131  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 
837 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30 
 
 
908 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.41 
 
 
1173 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
847 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 
908 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>