More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1575 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  56.79 
 
 		 701 aa  762    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.55 
 
 		 667 aa  812    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.42 
 
 		 695 aa  828    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 		 903 aa  1860    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.12 
 
 		 669 aa  798    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  44.65 
 
 		 825 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.93 
 
 		 825 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.58 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.26 
 
 		 684 aa  482  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.5 
 
 		 727 aa  469  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.42 
 
 		 697 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.77 
 
 		 820 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.11 
 
 		 699 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.41 
 
 		 816 aa  389  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.91 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 		 811 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.04 
 
 		 811 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 		 811 aa  356  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  34.81 
 
 		 799 aa  195  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  34.18 
 
 		 723 aa  184  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  32.67 
 
 		 727 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  33.33 
 
 		 712 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  33.42 
 
 		 824 aa  173  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  32.18 
 
 		 726 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 756 aa  168  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  31.54 
 
 		 760 aa  162  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  33.25 
 
 		 729 aa  162  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 		 706 aa  160  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.88 
 
 		 791 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.83 
 
 		 799 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 710 aa  156  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.24 
 
 		 693 aa  155  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  30.55 
 
 		 808 aa  154  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 751 aa  154  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.38 
 
 		 709 aa  151  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 729 aa  150  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 707 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.76 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 		 708 aa  148  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.81 
 
 		 746 aa  147  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 747 aa  144  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 747 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.54 
 
 		 694 aa  140  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 707 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 707 aa  138  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 739 aa  138  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1004 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 700 aa  114  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.12 
 
 		 837 aa  111  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 		 1004 aa  111  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.67 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.1 
 
 		 827 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.36 
 
 		 837 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 		 662 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.53 
 
 		 988 aa  108  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.47 
 
 		 1265 aa  106  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  27.61 
 
 		 885 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.67 
 
 		 800 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.62 
 
 		 950 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.11 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.5 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 852 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.31 
 
 		 1465 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  28.3 
 
 		 842 aa  102  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.72 
 
 		 838 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  29.49 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.39 
 
 		 894 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.5 
 
 		 785 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.18 
 
 		 845 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.52 
 
 		 856 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 851 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.12 
 
 		 831 aa  99  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  26.17 
 
 		 830 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.44 
 
 		 780 aa  99  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.79 
 
 		 2157 aa  98.2  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.74 
 
 		 889 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.34 
 
 		 893 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.82 
 
 		 873 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.29 
 
 		 866 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 		 847 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.41 
 
 		 901 aa  96.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 1231 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.95 
 
 		 807 aa  96.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  26.65 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 876 aa  95.5  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 		 853 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 832 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  26.29 
 
 		 853 aa  94  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 1230 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27 
 
 		 836 aa  94  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.95 
 
 		 835 aa  93.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.29 
 
 		 861 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 708 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  26.07 
 
 		 877 aa  91.3  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.22 
 
 		 874 aa  91.3  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.69 
 
 		 710 aa  90.9  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  26.93 
 
 		 891 aa  90.5  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.22 
 
 		 832 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>