More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0671 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.14 
 
 		 780 aa  1105    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.03 
 
 		 785 aa  1131    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.61 
 
 		 800 aa  1164    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.41 
 
 		 803 aa  1129    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 807 aa  1621    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  33.63 
 
 		 2111 aa  296  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  33.13 
 
 		 1770 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  33.63 
 
 		 2208 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  33.39 
 
 		 1767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  33.16 
 
 		 2015 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  32.67 
 
 		 2189 aa  270  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  31.02 
 
 		 2152 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  33.39 
 
 		 1942 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  34.01 
 
 		 1060 aa  267  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  31.83 
 
 		 2157 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  33.23 
 
 		 1589 aa  258  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.56 
 
 		 791 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 706 aa  243  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  30.63 
 
 		 729 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.36 
 
 		 799 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  32.69 
 
 		 1465 aa  233  8.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 		 729 aa  232  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.78 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  36.69 
 
 		 824 aa  226  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  30.07 
 
 		 726 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 756 aa  223  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  34.11 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.22 
 
 		 694 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 709 aa  220  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  30.06 
 
 		 808 aa  220  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  28.8 
 
 		 723 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 710 aa  218  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  29.73 
 
 		 712 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  29.97 
 
 		 1385 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 739 aa  211  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  31.41 
 
 		 693 aa  206  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  30.99 
 
 		 1710 aa  204  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 		 746 aa  204  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 747 aa  204  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.04 
 
 		 707 aa  204  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 747 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 		 700 aa  200  9e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.19 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.12 
 
 		 727 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 707 aa  194  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 707 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.6 
 
 		 1230 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 1318 aa  185  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.21 
 
 		 751 aa  180  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  30.36 
 
 		 874 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  29.08 
 
 		 926 aa  155  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  31.08 
 
 		 1055 aa  153  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  28.87 
 
 		 924 aa  150  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  28.07 
 
 		 924 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.12 
 
 		 905 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.13 
 
 		 927 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  27.91 
 
 		 927 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.1 
 
 		 893 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.48 
 
 		 919 aa  142  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.77 
 
 		 889 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  31.19 
 
 		 890 aa  142  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.13 
 
 		 872 aa  141  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  27.82 
 
 		 924 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.49 
 
 		 815 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 		 1265 aa  138  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  28.44 
 
 		 908 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  28.97 
 
 		 908 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.77 
 
 		 908 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  28.67 
 
 		 908 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.12 
 
 		 952 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.33 
 
 		 988 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 843 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.63 
 
 		 929 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 657 aa  128  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  29.57 
 
 		 906 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 		 762 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.9 
 
 		 996 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  25.99 
 
 		 901 aa  124  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.71 
 
 		 998 aa  124  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 919 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 811 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.41 
 
 		 1004 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.7 
 
 		 917 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 820 aa  119  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.97 
 
 		 845 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.96 
 
 		 811 aa  118  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.59 
 
 		 825 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  28.93 
 
 		 825 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.4 
 
 		 810 aa  115  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 		 817 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 		 1197 aa  114  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 811 aa  114  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  29.06 
 
 		 1165 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 876 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.88 
 
 		 402 aa  111  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.09 
 
 		 1173 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 		 727 aa  109  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>