More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2540 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.69 
 
 		 1230 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 1318 aa  2546    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 		 800 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.37 
 
 		 807 aa  201  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.45 
 
 		 780 aa  199  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.4 
 
 		 785 aa  178  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.89 
 
 		 723 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.67 
 
 		 803 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  30.66 
 
 		 729 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 747 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  30.65 
 
 		 712 aa  168  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 747 aa  166  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.13 
 
 		 707 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  26 
 
 		 1770 aa  165  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  32.46 
 
 		 824 aa  164  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 707 aa  164  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.77 
 
 		 746 aa  163  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.7 
 
 		 791 aa  163  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  28.1 
 
 		 1942 aa  163  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  29.61 
 
 		 2015 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.47 
 
 		 707 aa  161  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.31 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.66 
 
 		 694 aa  160  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 		 715 aa  159  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.56 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  30.91 
 
 		 1767 aa  159  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.11 
 
 		 760 aa  158  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  30.68 
 
 		 808 aa  154  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 751 aa  154  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.2 
 
 		 1465 aa  154  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.82 
 
 		 709 aa  153  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  29.27 
 
 		 693 aa  152  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  29 
 
 		 1060 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 		 706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.88 
 
 		 708 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.77 
 
 		 756 aa  148  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 700 aa  148  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  27.98 
 
 		 799 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  27.57 
 
 		 726 aa  141  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  27.88 
 
 		 1589 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.18 
 
 		 2111 aa  135  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  25.78 
 
 		 2189 aa  134  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  25.36 
 
 		 2152 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 729 aa  131  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  24.08 
 
 		 2208 aa  131  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  27.39 
 
 		 1710 aa  128  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1265 aa  128  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.01 
 
 		 662 aa  125  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  25.11 
 
 		 1385 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  28.5 
 
 		 901 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  25.32 
 
 		 2157 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.7 
 
 		 825 aa  119  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 739 aa  118  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 816 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 810 aa  111  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.8 
 
 		 811 aa  109  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  27.13 
 
 		 874 aa  109  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 		 1004 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 811 aa  108  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.22 
 
 		 820 aa  108  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  25.79 
 
 		 825 aa  103  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.26 
 
 		 1173 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.96 
 
 		 988 aa  101  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.73 
 
 		 811 aa  101  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.3 
 
 		 897 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  27.8 
 
 		 1165 aa  100  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.43 
 
 		 889 aa  99.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 1166 aa  99  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.24 
 
 		 402 aa  98.6  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  29.36 
 
 		 898 aa  98.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 		 909 aa  98.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.37 
 
 		 908 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.49 
 
 		 908 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.35 
 
 		 972 aa  95.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  27 
 
 		 882 aa  95.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.51 
 
 		 1173 aa  95.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  25.25 
 
 		 924 aa  95.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.94 
 
 		 845 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.15 
 
 		 1004 aa  94  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  29.91 
 
 		 954 aa  94  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.29 
 
 		 697 aa  94  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.65 
 
 		 926 aa  92.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.92 
 
 		 943 aa  92.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  24.94 
 
 		 908 aa  92.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.77 
 
 		 951 aa  92.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  30.7 
 
 		 939 aa  92.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.91 
 
 		 684 aa  91.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  29.39 
 
 		 946 aa  90.9  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.51 
 
 		 950 aa  87.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 		 996 aa  87.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  24.01 
 
 		 903 aa  87.8  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 916 aa  87.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.98 
 
 		 711 aa  87  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  23.39 
 
 		 905 aa  86.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 		 912 aa  86.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 903 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.62 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.07 
 
 		 1197 aa  85.9  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  39.53 
 
 		 916 aa  85.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>